Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPV9

TRAK1, Trafficking kinesin-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAK1Q9UPV9 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
TRAK1Q9UPV9 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
TRAK1Q9UPV9 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
TRAK1Q9UPV9 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
TRAK1Q9UPV9 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
TRAK1Q9UPV9 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
TRAK1Q9UPV9 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
TRAK1Q9UPV9 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
TRAK1Q9UPV9 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
TRAK1Q9UPV9 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
TRAK1Q9UPV9 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC29.66■■■□□ 2.34
TRAK1Q9UPV9 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
TRAK1Q9UPV9 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
TRAK1Q9UPV9 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC29.66■■■□□ 2.34
TRAK1Q9UPV9 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
TRAK1Q9UPV9 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
TRAK1Q9UPV9 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
TRAK1Q9UPV9 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
TRAK1Q9UPV9 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
TRAK1Q9UPV9 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC29.65■■■□□ 2.34
TRAK1Q9UPV9 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
TRAK1Q9UPV9 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
TRAK1Q9UPV9 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
TRAK1Q9UPV9 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
TRAK1Q9UPV9 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
TRAK1Q9UPV9 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
TRAK1Q9UPV9 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
TRAK1Q9UPV9 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC29.64■■■□□ 2.34
TRAK1Q9UPV9 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC29.64■■■□□ 2.34
TRAK1Q9UPV9 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
TRAK1Q9UPV9 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
TRAK1Q9UPV9 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
TRAK1Q9UPV9 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.33
TRAK1Q9UPV9 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
TRAK1Q9UPV9 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
TRAK1Q9UPV9 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
TRAK1Q9UPV9 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
TRAK1Q9UPV9 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
TRAK1Q9UPV9 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC29.63■■■□□ 2.33
TRAK1Q9UPV9 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
TRAK1Q9UPV9 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
TRAK1Q9UPV9 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
TRAK1Q9UPV9 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
TRAK1Q9UPV9 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
TRAK1Q9UPV9 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
TRAK1Q9UPV9 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
TRAK1Q9UPV9 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
TRAK1Q9UPV9 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
TRAK1Q9UPV9 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
TRAK1Q9UPV9 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
TRAK1Q9UPV9 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
TRAK1Q9UPV9 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
TRAK1Q9UPV9 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
TRAK1Q9UPV9 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
TRAK1Q9UPV9 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
TRAK1Q9UPV9 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
TRAK1Q9UPV9 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
TRAK1Q9UPV9 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
TRAK1Q9UPV9 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
TRAK1Q9UPV9 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
TRAK1Q9UPV9 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
TRAK1Q9UPV9 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
TRAK1Q9UPV9 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
TRAK1Q9UPV9 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
TRAK1Q9UPV9 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC29.6■■■□□ 2.33
TRAK1Q9UPV9 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
TRAK1Q9UPV9 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
TRAK1Q9UPV9 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
TRAK1Q9UPV9 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
TRAK1Q9UPV9 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.6■■■□□ 2.33
TRAK1Q9UPV9 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
TRAK1Q9UPV9 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
TRAK1Q9UPV9 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
TRAK1Q9UPV9 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
TRAK1Q9UPV9 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC29.59■■■□□ 2.33
TRAK1Q9UPV9 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
TRAK1Q9UPV9 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC29.59■■■□□ 2.33
TRAK1Q9UPV9 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
TRAK1Q9UPV9 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
TRAK1Q9UPV9 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
TRAK1Q9UPV9 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
TRAK1Q9UPV9 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
TRAK1Q9UPV9 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
TRAK1Q9UPV9 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
TRAK1Q9UPV9 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
TRAK1Q9UPV9 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
TRAK1Q9UPV9 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
TRAK1Q9UPV9 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
TRAK1Q9UPV9 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC29.58■■■□□ 2.33
TRAK1Q9UPV9 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC29.58■■■□□ 2.33
TRAK1Q9UPV9 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
TRAK1Q9UPV9 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
TRAK1Q9UPV9 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
TRAK1Q9UPV9 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
TRAK1Q9UPV9 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
TRAK1Q9UPV9 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
TRAK1Q9UPV9 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
TRAK1Q9UPV9 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC29.57■■■□□ 2.32
TRAK1Q9UPV9 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
TRAK1Q9UPV9 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms