Protein–RNA interactions for Protein: Q9UN75

PCDHA12, Protocadherin alpha-12, humanhuman

Predictions only

Length 941 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHA12Q9UN75 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PCDHA12Q9UN75 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PCDHA12Q9UN75 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PCDHA12Q9UN75 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PCDHA12Q9UN75 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PCDHA12Q9UN75 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PCDHA12Q9UN75 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PCDHA12Q9UN75 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PCDHA12Q9UN75 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PCDHA12Q9UN75 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PCDHA12Q9UN75 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PCDHA12Q9UN75 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PCDHA12Q9UN75 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PCDHA12Q9UN75 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
PCDHA12Q9UN75 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PCDHA12Q9UN75 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PCDHA12Q9UN75 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
PCDHA12Q9UN75 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PCDHA12Q9UN75 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PCDHA12Q9UN75 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PCDHA12Q9UN75 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PCDHA12Q9UN75 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PCDHA12Q9UN75 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PCDHA12Q9UN75 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PCDHA12Q9UN75 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PCDHA12Q9UN75 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PCDHA12Q9UN75 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PCDHA12Q9UN75 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PCDHA12Q9UN75 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PCDHA12Q9UN75 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PCDHA12Q9UN75 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PCDHA12Q9UN75 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PCDHA12Q9UN75 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PCDHA12Q9UN75 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PCDHA12Q9UN75 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PCDHA12Q9UN75 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PCDHA12Q9UN75 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PCDHA12Q9UN75 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PCDHA12Q9UN75 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PCDHA12Q9UN75 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PCDHA12Q9UN75 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PCDHA12Q9UN75 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PCDHA12Q9UN75 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PCDHA12Q9UN75 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PCDHA12Q9UN75 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PCDHA12Q9UN75 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
PCDHA12Q9UN75 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PCDHA12Q9UN75 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PCDHA12Q9UN75 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PCDHA12Q9UN75 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PCDHA12Q9UN75 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PCDHA12Q9UN75 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PCDHA12Q9UN75 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PCDHA12Q9UN75 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PCDHA12Q9UN75 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PCDHA12Q9UN75 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PCDHA12Q9UN75 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PCDHA12Q9UN75 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PCDHA12Q9UN75 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PCDHA12Q9UN75 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PCDHA12Q9UN75 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PCDHA12Q9UN75 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.39
PCDHA12Q9UN75 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PCDHA12Q9UN75 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PCDHA12Q9UN75 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PCDHA12Q9UN75 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PCDHA12Q9UN75 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PCDHA12Q9UN75 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
PCDHA12Q9UN75 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PCDHA12Q9UN75 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PCDHA12Q9UN75 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
PCDHA12Q9UN75 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PCDHA12Q9UN75 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PCDHA12Q9UN75 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PCDHA12Q9UN75 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PCDHA12Q9UN75 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PCDHA12Q9UN75 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PCDHA12Q9UN75 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PCDHA12Q9UN75 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PCDHA12Q9UN75 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PCDHA12Q9UN75 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PCDHA12Q9UN75 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PCDHA12Q9UN75 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PCDHA12Q9UN75 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PCDHA12Q9UN75 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PCDHA12Q9UN75 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PCDHA12Q9UN75 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PCDHA12Q9UN75 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
PCDHA12Q9UN75 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PCDHA12Q9UN75 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PCDHA12Q9UN75 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
PCDHA12Q9UN75 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PCDHA12Q9UN75 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
PCDHA12Q9UN75 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PCDHA12Q9UN75 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PCDHA12Q9UN75 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PCDHA12Q9UN75 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PCDHA12Q9UN75 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PCDHA12Q9UN75 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
PCDHA12Q9UN75 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms