Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKT5

FBXO4, F-box only protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO4Q9UKT5 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
FBXO4Q9UKT5 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
FBXO4Q9UKT5 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
FBXO4Q9UKT5 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
FBXO4Q9UKT5 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
FBXO4Q9UKT5 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
FBXO4Q9UKT5 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
FBXO4Q9UKT5 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
FBXO4Q9UKT5 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
FBXO4Q9UKT5 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
FBXO4Q9UKT5 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
FBXO4Q9UKT5 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
FBXO4Q9UKT5 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
FBXO4Q9UKT5 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
FBXO4Q9UKT5 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
FBXO4Q9UKT5 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
FBXO4Q9UKT5 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
FBXO4Q9UKT5 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
FBXO4Q9UKT5 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
FBXO4Q9UKT5 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
FBXO4Q9UKT5 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
FBXO4Q9UKT5 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
FBXO4Q9UKT5 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
FBXO4Q9UKT5 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
FBXO4Q9UKT5 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
FBXO4Q9UKT5 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
FBXO4Q9UKT5 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
FBXO4Q9UKT5 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
FBXO4Q9UKT5 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
FBXO4Q9UKT5 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
FBXO4Q9UKT5 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
FBXO4Q9UKT5 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
FBXO4Q9UKT5 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
FBXO4Q9UKT5 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
FBXO4Q9UKT5 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
FBXO4Q9UKT5 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
FBXO4Q9UKT5 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
FBXO4Q9UKT5 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
FBXO4Q9UKT5 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
FBXO4Q9UKT5 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
FBXO4Q9UKT5 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
FBXO4Q9UKT5 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
FBXO4Q9UKT5 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
FBXO4Q9UKT5 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
FBXO4Q9UKT5 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
FBXO4Q9UKT5 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
FBXO4Q9UKT5 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
FBXO4Q9UKT5 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
FBXO4Q9UKT5 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
FBXO4Q9UKT5 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
FBXO4Q9UKT5 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
FBXO4Q9UKT5 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
FBXO4Q9UKT5 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
FBXO4Q9UKT5 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
FBXO4Q9UKT5 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
FBXO4Q9UKT5 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
FBXO4Q9UKT5 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
FBXO4Q9UKT5 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
FBXO4Q9UKT5 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
FBXO4Q9UKT5 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
FBXO4Q9UKT5 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
FBXO4Q9UKT5 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
FBXO4Q9UKT5 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
FBXO4Q9UKT5 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
FBXO4Q9UKT5 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
FBXO4Q9UKT5 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
FBXO4Q9UKT5 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
FBXO4Q9UKT5 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
FBXO4Q9UKT5 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
FBXO4Q9UKT5 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
FBXO4Q9UKT5 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
FBXO4Q9UKT5 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
FBXO4Q9UKT5 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
FBXO4Q9UKT5 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
FBXO4Q9UKT5 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
FBXO4Q9UKT5 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
FBXO4Q9UKT5 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
FBXO4Q9UKT5 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
FBXO4Q9UKT5 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
FBXO4Q9UKT5 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
FBXO4Q9UKT5 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
FBXO4Q9UKT5 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
FBXO4Q9UKT5 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
FBXO4Q9UKT5 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
FBXO4Q9UKT5 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
FBXO4Q9UKT5 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
FBXO4Q9UKT5 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
FBXO4Q9UKT5 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
FBXO4Q9UKT5 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
FBXO4Q9UKT5 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
FBXO4Q9UKT5 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
FBXO4Q9UKT5 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
FBXO4Q9UKT5 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
FBXO4Q9UKT5 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
FBXO4Q9UKT5 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
FBXO4Q9UKT5 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
FBXO4Q9UKT5 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
FBXO4Q9UKT5 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
FBXO4Q9UKT5 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
FBXO4Q9UKT5 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms