Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKR8

TSPAN16, Tetraspanin-16, humanhuman

Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN16Q9UKR8 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TSPAN16Q9UKR8 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TSPAN16Q9UKR8 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TSPAN16Q9UKR8 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TSPAN16Q9UKR8 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TSPAN16Q9UKR8 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TSPAN16Q9UKR8 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TSPAN16Q9UKR8 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TSPAN16Q9UKR8 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TSPAN16Q9UKR8 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TSPAN16Q9UKR8 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
TSPAN16Q9UKR8 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TSPAN16Q9UKR8 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TSPAN16Q9UKR8 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TSPAN16Q9UKR8 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TSPAN16Q9UKR8 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TSPAN16Q9UKR8 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TSPAN16Q9UKR8 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TSPAN16Q9UKR8 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TSPAN16Q9UKR8 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TSPAN16Q9UKR8 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TSPAN16Q9UKR8 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TSPAN16Q9UKR8 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TSPAN16Q9UKR8 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TSPAN16Q9UKR8 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TSPAN16Q9UKR8 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
TSPAN16Q9UKR8 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TSPAN16Q9UKR8 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TSPAN16Q9UKR8 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TSPAN16Q9UKR8 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TSPAN16Q9UKR8 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TSPAN16Q9UKR8 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TSPAN16Q9UKR8 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TSPAN16Q9UKR8 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TSPAN16Q9UKR8 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TSPAN16Q9UKR8 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TSPAN16Q9UKR8 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TSPAN16Q9UKR8 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TSPAN16Q9UKR8 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TSPAN16Q9UKR8 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TSPAN16Q9UKR8 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TSPAN16Q9UKR8 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TSPAN16Q9UKR8 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TSPAN16Q9UKR8 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
TSPAN16Q9UKR8 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TSPAN16Q9UKR8 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TSPAN16Q9UKR8 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
TSPAN16Q9UKR8 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TSPAN16Q9UKR8 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TSPAN16Q9UKR8 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TSPAN16Q9UKR8 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TSPAN16Q9UKR8 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TSPAN16Q9UKR8 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TSPAN16Q9UKR8 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TSPAN16Q9UKR8 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TSPAN16Q9UKR8 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TSPAN16Q9UKR8 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TSPAN16Q9UKR8 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TSPAN16Q9UKR8 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TSPAN16Q9UKR8 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TSPAN16Q9UKR8 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TSPAN16Q9UKR8 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TSPAN16Q9UKR8 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TSPAN16Q9UKR8 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TSPAN16Q9UKR8 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TSPAN16Q9UKR8 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TSPAN16Q9UKR8 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TSPAN16Q9UKR8 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TSPAN16Q9UKR8 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TSPAN16Q9UKR8 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TSPAN16Q9UKR8 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TSPAN16Q9UKR8 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TSPAN16Q9UKR8 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TSPAN16Q9UKR8 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TSPAN16Q9UKR8 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TSPAN16Q9UKR8 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TSPAN16Q9UKR8 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
TSPAN16Q9UKR8 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TSPAN16Q9UKR8 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TSPAN16Q9UKR8 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TSPAN16Q9UKR8 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TSPAN16Q9UKR8 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TSPAN16Q9UKR8 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TSPAN16Q9UKR8 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TSPAN16Q9UKR8 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TSPAN16Q9UKR8 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TSPAN16Q9UKR8 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TSPAN16Q9UKR8 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TSPAN16Q9UKR8 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TSPAN16Q9UKR8 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TSPAN16Q9UKR8 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TSPAN16Q9UKR8 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TSPAN16Q9UKR8 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TSPAN16Q9UKR8 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
TSPAN16Q9UKR8 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TSPAN16Q9UKR8 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TSPAN16Q9UKR8 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TSPAN16Q9UKR8 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TSPAN16Q9UKR8 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TSPAN16Q9UKR8 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms