Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIG8

SLCO3A1, Solute carrier organic anion transporter family member 3A1, humanhuman

Predictions only

Length 710 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLCO3A1Q9UIG8 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLCO3A1Q9UIG8 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLCO3A1Q9UIG8 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
SLCO3A1Q9UIG8 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
SLCO3A1Q9UIG8 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLCO3A1Q9UIG8 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLCO3A1Q9UIG8 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLCO3A1Q9UIG8 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
SLCO3A1Q9UIG8 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
SLCO3A1Q9UIG8 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLCO3A1Q9UIG8 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLCO3A1Q9UIG8 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLCO3A1Q9UIG8 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLCO3A1Q9UIG8 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLCO3A1Q9UIG8 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLCO3A1Q9UIG8 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLCO3A1Q9UIG8 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLCO3A1Q9UIG8 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLCO3A1Q9UIG8 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLCO3A1Q9UIG8 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLCO3A1Q9UIG8 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLCO3A1Q9UIG8 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLCO3A1Q9UIG8 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLCO3A1Q9UIG8 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLCO3A1Q9UIG8 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLCO3A1Q9UIG8 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLCO3A1Q9UIG8 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SLCO3A1Q9UIG8 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLCO3A1Q9UIG8 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLCO3A1Q9UIG8 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLCO3A1Q9UIG8 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLCO3A1Q9UIG8 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLCO3A1Q9UIG8 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLCO3A1Q9UIG8 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLCO3A1Q9UIG8 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLCO3A1Q9UIG8 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLCO3A1Q9UIG8 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLCO3A1Q9UIG8 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLCO3A1Q9UIG8 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLCO3A1Q9UIG8 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLCO3A1Q9UIG8 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SLCO3A1Q9UIG8 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLCO3A1Q9UIG8 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLCO3A1Q9UIG8 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLCO3A1Q9UIG8 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLCO3A1Q9UIG8 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLCO3A1Q9UIG8 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLCO3A1Q9UIG8 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLCO3A1Q9UIG8 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SLCO3A1Q9UIG8 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLCO3A1Q9UIG8 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLCO3A1Q9UIG8 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SLCO3A1Q9UIG8 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SLCO3A1Q9UIG8 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLCO3A1Q9UIG8 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLCO3A1Q9UIG8 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLCO3A1Q9UIG8 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLCO3A1Q9UIG8 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLCO3A1Q9UIG8 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLCO3A1Q9UIG8 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLCO3A1Q9UIG8 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLCO3A1Q9UIG8 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLCO3A1Q9UIG8 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLCO3A1Q9UIG8 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLCO3A1Q9UIG8 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLCO3A1Q9UIG8 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLCO3A1Q9UIG8 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLCO3A1Q9UIG8 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SLCO3A1Q9UIG8 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLCO3A1Q9UIG8 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLCO3A1Q9UIG8 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLCO3A1Q9UIG8 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLCO3A1Q9UIG8 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLCO3A1Q9UIG8 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLCO3A1Q9UIG8 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLCO3A1Q9UIG8 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLCO3A1Q9UIG8 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLCO3A1Q9UIG8 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLCO3A1Q9UIG8 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLCO3A1Q9UIG8 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLCO3A1Q9UIG8 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLCO3A1Q9UIG8 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLCO3A1Q9UIG8 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLCO3A1Q9UIG8 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLCO3A1Q9UIG8 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLCO3A1Q9UIG8 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLCO3A1Q9UIG8 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLCO3A1Q9UIG8 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLCO3A1Q9UIG8 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLCO3A1Q9UIG8 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLCO3A1Q9UIG8 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLCO3A1Q9UIG8 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SLCO3A1Q9UIG8 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SLCO3A1Q9UIG8 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SLCO3A1Q9UIG8 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SLCO3A1Q9UIG8 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SLCO3A1Q9UIG8 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
SLCO3A1Q9UIG8 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLCO3A1Q9UIG8 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLCO3A1Q9UIG8 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms