Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI47

CTNNA3, Catenin alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 895 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNA3Q9UI47 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CTNNA3Q9UI47 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CTNNA3Q9UI47 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CTNNA3Q9UI47 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CTNNA3Q9UI47 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CTNNA3Q9UI47 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CTNNA3Q9UI47 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CTNNA3Q9UI47 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CTNNA3Q9UI47 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CTNNA3Q9UI47 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CTNNA3Q9UI47 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CTNNA3Q9UI47 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CTNNA3Q9UI47 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CTNNA3Q9UI47 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CTNNA3Q9UI47 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CTNNA3Q9UI47 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CTNNA3Q9UI47 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
CTNNA3Q9UI47 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CTNNA3Q9UI47 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CTNNA3Q9UI47 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CTNNA3Q9UI47 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CTNNA3Q9UI47 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CTNNA3Q9UI47 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CTNNA3Q9UI47 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CTNNA3Q9UI47 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CTNNA3Q9UI47 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CTNNA3Q9UI47 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CTNNA3Q9UI47 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CTNNA3Q9UI47 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CTNNA3Q9UI47 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CTNNA3Q9UI47 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CTNNA3Q9UI47 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CTNNA3Q9UI47 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CTNNA3Q9UI47 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CTNNA3Q9UI47 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CTNNA3Q9UI47 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CTNNA3Q9UI47 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CTNNA3Q9UI47 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CTNNA3Q9UI47 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CTNNA3Q9UI47 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CTNNA3Q9UI47 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CTNNA3Q9UI47 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
CTNNA3Q9UI47 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CTNNA3Q9UI47 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CTNNA3Q9UI47 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CTNNA3Q9UI47 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CTNNA3Q9UI47 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CTNNA3Q9UI47 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CTNNA3Q9UI47 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CTNNA3Q9UI47 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CTNNA3Q9UI47 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CTNNA3Q9UI47 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CTNNA3Q9UI47 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CTNNA3Q9UI47 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CTNNA3Q9UI47 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
CTNNA3Q9UI47 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CTNNA3Q9UI47 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CTNNA3Q9UI47 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CTNNA3Q9UI47 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CTNNA3Q9UI47 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CTNNA3Q9UI47 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CTNNA3Q9UI47 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
CTNNA3Q9UI47 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CTNNA3Q9UI47 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CTNNA3Q9UI47 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CTNNA3Q9UI47 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CTNNA3Q9UI47 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CTNNA3Q9UI47 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CTNNA3Q9UI47 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CTNNA3Q9UI47 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CTNNA3Q9UI47 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CTNNA3Q9UI47 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CTNNA3Q9UI47 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CTNNA3Q9UI47 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CTNNA3Q9UI47 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CTNNA3Q9UI47 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CTNNA3Q9UI47 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
CTNNA3Q9UI47 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CTNNA3Q9UI47 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CTNNA3Q9UI47 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
CTNNA3Q9UI47 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CTNNA3Q9UI47 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CTNNA3Q9UI47 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CTNNA3Q9UI47 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CTNNA3Q9UI47 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CTNNA3Q9UI47 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CTNNA3Q9UI47 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CTNNA3Q9UI47 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CTNNA3Q9UI47 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CTNNA3Q9UI47 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CTNNA3Q9UI47 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
CTNNA3Q9UI47 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CTNNA3Q9UI47 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CTNNA3Q9UI47 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CTNNA3Q9UI47 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CTNNA3Q9UI47 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CTNNA3Q9UI47 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CTNNA3Q9UI47 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CTNNA3Q9UI47 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CTNNA3Q9UI47 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms