Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHL9

GTF2IRD1, General transcription factor II-I repeat domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 959 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2IRD1Q9UHL9 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GTF2IRD1Q9UHL9 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GTF2IRD1Q9UHL9 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GTF2IRD1Q9UHL9 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GTF2IRD1Q9UHL9 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GTF2IRD1Q9UHL9 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GTF2IRD1Q9UHL9 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GTF2IRD1Q9UHL9 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GTF2IRD1Q9UHL9 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GTF2IRD1Q9UHL9 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GTF2IRD1Q9UHL9 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GTF2IRD1Q9UHL9 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GTF2IRD1Q9UHL9 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GTF2IRD1Q9UHL9 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GTF2IRD1Q9UHL9 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GTF2IRD1Q9UHL9 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GTF2IRD1Q9UHL9 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GTF2IRD1Q9UHL9 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GTF2IRD1Q9UHL9 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GTF2IRD1Q9UHL9 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GTF2IRD1Q9UHL9 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
GTF2IRD1Q9UHL9 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GTF2IRD1Q9UHL9 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GTF2IRD1Q9UHL9 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GTF2IRD1Q9UHL9 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GTF2IRD1Q9UHL9 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GTF2IRD1Q9UHL9 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
GTF2IRD1Q9UHL9 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GTF2IRD1Q9UHL9 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GTF2IRD1Q9UHL9 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GTF2IRD1Q9UHL9 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GTF2IRD1Q9UHL9 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
GTF2IRD1Q9UHL9 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
GTF2IRD1Q9UHL9 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GTF2IRD1Q9UHL9 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GTF2IRD1Q9UHL9 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GTF2IRD1Q9UHL9 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GTF2IRD1Q9UHL9 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GTF2IRD1Q9UHL9 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GTF2IRD1Q9UHL9 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GTF2IRD1Q9UHL9 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GTF2IRD1Q9UHL9 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GTF2IRD1Q9UHL9 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GTF2IRD1Q9UHL9 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GTF2IRD1Q9UHL9 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GTF2IRD1Q9UHL9 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GTF2IRD1Q9UHL9 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GTF2IRD1Q9UHL9 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GTF2IRD1Q9UHL9 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GTF2IRD1Q9UHL9 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GTF2IRD1Q9UHL9 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GTF2IRD1Q9UHL9 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GTF2IRD1Q9UHL9 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GTF2IRD1Q9UHL9 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GTF2IRD1Q9UHL9 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GTF2IRD1Q9UHL9 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GTF2IRD1Q9UHL9 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GTF2IRD1Q9UHL9 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GTF2IRD1Q9UHL9 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GTF2IRD1Q9UHL9 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GTF2IRD1Q9UHL9 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GTF2IRD1Q9UHL9 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GTF2IRD1Q9UHL9 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GTF2IRD1Q9UHL9 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GTF2IRD1Q9UHL9 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GTF2IRD1Q9UHL9 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GTF2IRD1Q9UHL9 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GTF2IRD1Q9UHL9 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GTF2IRD1Q9UHL9 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GTF2IRD1Q9UHL9 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GTF2IRD1Q9UHL9 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GTF2IRD1Q9UHL9 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
GTF2IRD1Q9UHL9 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GTF2IRD1Q9UHL9 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GTF2IRD1Q9UHL9 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GTF2IRD1Q9UHL9 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GTF2IRD1Q9UHL9 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GTF2IRD1Q9UHL9 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GTF2IRD1Q9UHL9 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GTF2IRD1Q9UHL9 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GTF2IRD1Q9UHL9 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GTF2IRD1Q9UHL9 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GTF2IRD1Q9UHL9 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GTF2IRD1Q9UHL9 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GTF2IRD1Q9UHL9 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GTF2IRD1Q9UHL9 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
GTF2IRD1Q9UHL9 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GTF2IRD1Q9UHL9 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GTF2IRD1Q9UHL9 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GTF2IRD1Q9UHL9 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GTF2IRD1Q9UHL9 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GTF2IRD1Q9UHL9 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GTF2IRD1Q9UHL9 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GTF2IRD1Q9UHL9 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GTF2IRD1Q9UHL9 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GTF2IRD1Q9UHL9 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GTF2IRD1Q9UHL9 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GTF2IRD1Q9UHL9 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GTF2IRD1Q9UHL9 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
GTF2IRD1Q9UHL9 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms