Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHB9

SRP68, Signal recognition particle subunit SRP68, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRP68Q9UHB9 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SRP68Q9UHB9 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
SRP68Q9UHB9 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SRP68Q9UHB9 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SRP68Q9UHB9 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SRP68Q9UHB9 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
SRP68Q9UHB9 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SRP68Q9UHB9 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SRP68Q9UHB9 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SRP68Q9UHB9 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SRP68Q9UHB9 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SRP68Q9UHB9 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SRP68Q9UHB9 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SRP68Q9UHB9 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SRP68Q9UHB9 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SRP68Q9UHB9 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SRP68Q9UHB9 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SRP68Q9UHB9 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SRP68Q9UHB9 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SRP68Q9UHB9 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SRP68Q9UHB9 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SRP68Q9UHB9 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SRP68Q9UHB9 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SRP68Q9UHB9 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SRP68Q9UHB9 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SRP68Q9UHB9 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SRP68Q9UHB9 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SRP68Q9UHB9 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SRP68Q9UHB9 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SRP68Q9UHB9 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SRP68Q9UHB9 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SRP68Q9UHB9 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SRP68Q9UHB9 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SRP68Q9UHB9 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SRP68Q9UHB9 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SRP68Q9UHB9 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SRP68Q9UHB9 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SRP68Q9UHB9 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SRP68Q9UHB9 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SRP68Q9UHB9 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SRP68Q9UHB9 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SRP68Q9UHB9 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SRP68Q9UHB9 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SRP68Q9UHB9 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SRP68Q9UHB9 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SRP68Q9UHB9 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SRP68Q9UHB9 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SRP68Q9UHB9 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SRP68Q9UHB9 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SRP68Q9UHB9 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
SRP68Q9UHB9 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SRP68Q9UHB9 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SRP68Q9UHB9 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SRP68Q9UHB9 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SRP68Q9UHB9 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SRP68Q9UHB9 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SRP68Q9UHB9 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SRP68Q9UHB9 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SRP68Q9UHB9 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SRP68Q9UHB9 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SRP68Q9UHB9 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SRP68Q9UHB9 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SRP68Q9UHB9 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SRP68Q9UHB9 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SRP68Q9UHB9 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SRP68Q9UHB9 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SRP68Q9UHB9 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SRP68Q9UHB9 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.85
SRP68Q9UHB9 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
SRP68Q9UHB9 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
SRP68Q9UHB9 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SRP68Q9UHB9 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SRP68Q9UHB9 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
SRP68Q9UHB9 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SRP68Q9UHB9 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SRP68Q9UHB9 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SRP68Q9UHB9 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SRP68Q9UHB9 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SRP68Q9UHB9 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SRP68Q9UHB9 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SRP68Q9UHB9 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SRP68Q9UHB9 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SRP68Q9UHB9 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SRP68Q9UHB9 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
SRP68Q9UHB9 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SRP68Q9UHB9 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SRP68Q9UHB9 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SRP68Q9UHB9 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SRP68Q9UHB9 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SRP68Q9UHB9 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SRP68Q9UHB9 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SRP68Q9UHB9 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SRP68Q9UHB9 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SRP68Q9UHB9 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SRP68Q9UHB9 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SRP68Q9UHB9 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
SRP68Q9UHB9 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SRP68Q9UHB9 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SRP68Q9UHB9 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SRP68Q9UHB9 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms