Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGL1

KDM5B, Lysine-specific demethylase 5B, humanhuman

Predictions only

Length 1,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5BQ9UGL1 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
KDM5BQ9UGL1 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
KDM5BQ9UGL1 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
KDM5BQ9UGL1 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC33.24■■■□□ 2.91
KDM5BQ9UGL1 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
KDM5BQ9UGL1 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
KDM5BQ9UGL1 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC33.24■■■□□ 2.91
KDM5BQ9UGL1 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
KDM5BQ9UGL1 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC33.24■■■□□ 2.91
KDM5BQ9UGL1 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
KDM5BQ9UGL1 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.24■■■□□ 2.91
KDM5BQ9UGL1 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
KDM5BQ9UGL1 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC33.24■■■□□ 2.91
KDM5BQ9UGL1 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
KDM5BQ9UGL1 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
KDM5BQ9UGL1 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC33.23■■■□□ 2.91
KDM5BQ9UGL1 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.23■■■□□ 2.91
KDM5BQ9UGL1 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC33.23■■■□□ 2.91
KDM5BQ9UGL1 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
KDM5BQ9UGL1 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC33.23■■■□□ 2.91
KDM5BQ9UGL1 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
KDM5BQ9UGL1 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC33.23■■■□□ 2.91
KDM5BQ9UGL1 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.23■■■□□ 2.91
KDM5BQ9UGL1 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC33.23■■■□□ 2.91
KDM5BQ9UGL1 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
KDM5BQ9UGL1 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
KDM5BQ9UGL1 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
KDM5BQ9UGL1 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC33.23■■■□□ 2.91
KDM5BQ9UGL1 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
KDM5BQ9UGL1 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
KDM5BQ9UGL1 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.22■■■□□ 2.91
KDM5BQ9UGL1 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
KDM5BQ9UGL1 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC33.22■■■□□ 2.91
KDM5BQ9UGL1 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
KDM5BQ9UGL1 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC33.22■■■□□ 2.91
KDM5BQ9UGL1 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
KDM5BQ9UGL1 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.21■■■□□ 2.91
KDM5BQ9UGL1 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC33.21■■■□□ 2.91
KDM5BQ9UGL1 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC33.21■■■□□ 2.91
KDM5BQ9UGL1 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC33.21■■■□□ 2.91
KDM5BQ9UGL1 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC33.21■■■□□ 2.91
KDM5BQ9UGL1 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
KDM5BQ9UGL1 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC33.2■■■□□ 2.91
KDM5BQ9UGL1 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC33.2■■■□□ 2.91
KDM5BQ9UGL1 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC33.2■■■□□ 2.91
KDM5BQ9UGL1 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
KDM5BQ9UGL1 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC33.19■■■□□ 2.9
KDM5BQ9UGL1 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
KDM5BQ9UGL1 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC33.19■■■□□ 2.9
KDM5BQ9UGL1 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC33.19■■■□□ 2.9
KDM5BQ9UGL1 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
KDM5BQ9UGL1 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
KDM5BQ9UGL1 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
KDM5BQ9UGL1 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
KDM5BQ9UGL1 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC33.18■■■□□ 2.9
KDM5BQ9UGL1 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC33.18■■■□□ 2.9
KDM5BQ9UGL1 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC33.18■■■□□ 2.9
KDM5BQ9UGL1 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC33.18■■■□□ 2.9
KDM5BQ9UGL1 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC33.18■■■□□ 2.9
KDM5BQ9UGL1 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC33.18■■■□□ 2.9
KDM5BQ9UGL1 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC33.18■■■□□ 2.9
KDM5BQ9UGL1 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.18■■■□□ 2.9
KDM5BQ9UGL1 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
KDM5BQ9UGL1 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC33.18■■■□□ 2.9
KDM5BQ9UGL1 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
KDM5BQ9UGL1 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC33.18■■■□□ 2.9
KDM5BQ9UGL1 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC33.17■■■□□ 2.9
KDM5BQ9UGL1 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
KDM5BQ9UGL1 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
KDM5BQ9UGL1 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.17■■■□□ 2.9
KDM5BQ9UGL1 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.17■■■□□ 2.9
KDM5BQ9UGL1 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC33.17■■■□□ 2.9
KDM5BQ9UGL1 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
KDM5BQ9UGL1 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC33.17■■■□□ 2.9
KDM5BQ9UGL1 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
KDM5BQ9UGL1 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
KDM5BQ9UGL1 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.16■■■□□ 2.9
KDM5BQ9UGL1 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC33.16■■■□□ 2.9
KDM5BQ9UGL1 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC33.16■■■□□ 2.9
KDM5BQ9UGL1 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC33.16■■■□□ 2.9
KDM5BQ9UGL1 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC33.16■■■□□ 2.9
KDM5BQ9UGL1 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC33.16■■■□□ 2.9
KDM5BQ9UGL1 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC33.16■■■□□ 2.9
KDM5BQ9UGL1 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.16■■■□□ 2.9
KDM5BQ9UGL1 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC33.15■■■□□ 2.9
KDM5BQ9UGL1 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
KDM5BQ9UGL1 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
KDM5BQ9UGL1 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
KDM5BQ9UGL1 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.15■■■□□ 2.9
KDM5BQ9UGL1 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC33.15■■■□□ 2.9
KDM5BQ9UGL1 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
KDM5BQ9UGL1 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
KDM5BQ9UGL1 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
KDM5BQ9UGL1 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.14■■■□□ 2.9
KDM5BQ9UGL1 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
KDM5BQ9UGL1 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
KDM5BQ9UGL1 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
KDM5BQ9UGL1 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.14■■■□□ 2.9
KDM5BQ9UGL1 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
KDM5BQ9UGL1 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC33.14■■■□□ 2.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms