Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E5

CHPF2, Chondroitin sulfate glucuronyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHPF2Q9P2E5 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CHPF2Q9P2E5 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CHPF2Q9P2E5 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CHPF2Q9P2E5 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CHPF2Q9P2E5 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CHPF2Q9P2E5 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CHPF2Q9P2E5 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CHPF2Q9P2E5 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CHPF2Q9P2E5 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CHPF2Q9P2E5 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CHPF2Q9P2E5 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CHPF2Q9P2E5 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CHPF2Q9P2E5 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CHPF2Q9P2E5 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CHPF2Q9P2E5 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CHPF2Q9P2E5 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CHPF2Q9P2E5 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CHPF2Q9P2E5 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CHPF2Q9P2E5 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CHPF2Q9P2E5 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CHPF2Q9P2E5 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CHPF2Q9P2E5 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CHPF2Q9P2E5 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CHPF2Q9P2E5 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CHPF2Q9P2E5 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CHPF2Q9P2E5 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CHPF2Q9P2E5 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CHPF2Q9P2E5 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CHPF2Q9P2E5 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CHPF2Q9P2E5 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
CHPF2Q9P2E5 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CHPF2Q9P2E5 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CHPF2Q9P2E5 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CHPF2Q9P2E5 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
CHPF2Q9P2E5 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CHPF2Q9P2E5 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
CHPF2Q9P2E5 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CHPF2Q9P2E5 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CHPF2Q9P2E5 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CHPF2Q9P2E5 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
CHPF2Q9P2E5 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CHPF2Q9P2E5 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CHPF2Q9P2E5 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CHPF2Q9P2E5 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CHPF2Q9P2E5 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CHPF2Q9P2E5 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CHPF2Q9P2E5 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CHPF2Q9P2E5 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CHPF2Q9P2E5 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CHPF2Q9P2E5 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
CHPF2Q9P2E5 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CHPF2Q9P2E5 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CHPF2Q9P2E5 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CHPF2Q9P2E5 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CHPF2Q9P2E5 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
CHPF2Q9P2E5 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CHPF2Q9P2E5 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CHPF2Q9P2E5 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CHPF2Q9P2E5 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CHPF2Q9P2E5 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
CHPF2Q9P2E5 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CHPF2Q9P2E5 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CHPF2Q9P2E5 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CHPF2Q9P2E5 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CHPF2Q9P2E5 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CHPF2Q9P2E5 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CHPF2Q9P2E5 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CHPF2Q9P2E5 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
CHPF2Q9P2E5 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
CHPF2Q9P2E5 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
CHPF2Q9P2E5 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CHPF2Q9P2E5 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CHPF2Q9P2E5 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CHPF2Q9P2E5 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CHPF2Q9P2E5 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CHPF2Q9P2E5 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CHPF2Q9P2E5 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CHPF2Q9P2E5 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CHPF2Q9P2E5 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CHPF2Q9P2E5 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CHPF2Q9P2E5 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
CHPF2Q9P2E5 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CHPF2Q9P2E5 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CHPF2Q9P2E5 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CHPF2Q9P2E5 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CHPF2Q9P2E5 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CHPF2Q9P2E5 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CHPF2Q9P2E5 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CHPF2Q9P2E5 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CHPF2Q9P2E5 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CHPF2Q9P2E5 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CHPF2Q9P2E5 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CHPF2Q9P2E5 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CHPF2Q9P2E5 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CHPF2Q9P2E5 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CHPF2Q9P2E5 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CHPF2Q9P2E5 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CHPF2Q9P2E5 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CHPF2Q9P2E5 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CHPF2Q9P2E5 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms