Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2B2

PTGFRN, Prostaglandin F2 receptor negative regulator, humanhuman

Predictions only

Length 879 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGFRNQ9P2B2 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTGFRNQ9P2B2 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTGFRNQ9P2B2 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTGFRNQ9P2B2 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTGFRNQ9P2B2 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTGFRNQ9P2B2 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
PTGFRNQ9P2B2 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTGFRNQ9P2B2 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTGFRNQ9P2B2 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTGFRNQ9P2B2 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTGFRNQ9P2B2 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTGFRNQ9P2B2 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
PTGFRNQ9P2B2 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTGFRNQ9P2B2 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTGFRNQ9P2B2 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTGFRNQ9P2B2 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
PTGFRNQ9P2B2 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
PTGFRNQ9P2B2 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PTGFRNQ9P2B2 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
PTGFRNQ9P2B2 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PTGFRNQ9P2B2 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PTGFRNQ9P2B2 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PTGFRNQ9P2B2 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PTGFRNQ9P2B2 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PTGFRNQ9P2B2 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PTGFRNQ9P2B2 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PTGFRNQ9P2B2 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PTGFRNQ9P2B2 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PTGFRNQ9P2B2 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PTGFRNQ9P2B2 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PTGFRNQ9P2B2 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PTGFRNQ9P2B2 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PTGFRNQ9P2B2 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PTGFRNQ9P2B2 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PTGFRNQ9P2B2 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PTGFRNQ9P2B2 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
PTGFRNQ9P2B2 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PTGFRNQ9P2B2 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PTGFRNQ9P2B2 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PTGFRNQ9P2B2 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PTGFRNQ9P2B2 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PTGFRNQ9P2B2 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PTGFRNQ9P2B2 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PTGFRNQ9P2B2 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PTGFRNQ9P2B2 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PTGFRNQ9P2B2 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PTGFRNQ9P2B2 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PTGFRNQ9P2B2 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PTGFRNQ9P2B2 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PTGFRNQ9P2B2 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PTGFRNQ9P2B2 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PTGFRNQ9P2B2 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PTGFRNQ9P2B2 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PTGFRNQ9P2B2 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PTGFRNQ9P2B2 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PTGFRNQ9P2B2 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PTGFRNQ9P2B2 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PTGFRNQ9P2B2 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PTGFRNQ9P2B2 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PTGFRNQ9P2B2 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
PTGFRNQ9P2B2 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PTGFRNQ9P2B2 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PTGFRNQ9P2B2 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PTGFRNQ9P2B2 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PTGFRNQ9P2B2 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PTGFRNQ9P2B2 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PTGFRNQ9P2B2 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PTGFRNQ9P2B2 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PTGFRNQ9P2B2 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PTGFRNQ9P2B2 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PTGFRNQ9P2B2 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PTGFRNQ9P2B2 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PTGFRNQ9P2B2 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PTGFRNQ9P2B2 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PTGFRNQ9P2B2 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PTGFRNQ9P2B2 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PTGFRNQ9P2B2 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PTGFRNQ9P2B2 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
PTGFRNQ9P2B2 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
PTGFRNQ9P2B2 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
PTGFRNQ9P2B2 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PTGFRNQ9P2B2 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PTGFRNQ9P2B2 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PTGFRNQ9P2B2 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PTGFRNQ9P2B2 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PTGFRNQ9P2B2 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PTGFRNQ9P2B2 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PTGFRNQ9P2B2 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PTGFRNQ9P2B2 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PTGFRNQ9P2B2 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PTGFRNQ9P2B2 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PTGFRNQ9P2B2 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PTGFRNQ9P2B2 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PTGFRNQ9P2B2 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PTGFRNQ9P2B2 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
PTGFRNQ9P2B2 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PTGFRNQ9P2B2 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PTGFRNQ9P2B2 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
PTGFRNQ9P2B2 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PTGFRNQ9P2B2 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms