Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZ71

RTEL1, Regulator of telomere elongation helicase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTEL1Q9NZ71 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RTEL1Q9NZ71 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RTEL1Q9NZ71 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RTEL1Q9NZ71 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RTEL1Q9NZ71 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RTEL1Q9NZ71 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RTEL1Q9NZ71 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RTEL1Q9NZ71 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RTEL1Q9NZ71 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RTEL1Q9NZ71 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RTEL1Q9NZ71 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RTEL1Q9NZ71 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RTEL1Q9NZ71 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RTEL1Q9NZ71 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RTEL1Q9NZ71 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RTEL1Q9NZ71 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RTEL1Q9NZ71 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RTEL1Q9NZ71 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RTEL1Q9NZ71 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RTEL1Q9NZ71 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RTEL1Q9NZ71 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RTEL1Q9NZ71 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RTEL1Q9NZ71 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RTEL1Q9NZ71 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RTEL1Q9NZ71 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RTEL1Q9NZ71 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
RTEL1Q9NZ71 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
RTEL1Q9NZ71 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RTEL1Q9NZ71 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RTEL1Q9NZ71 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RTEL1Q9NZ71 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RTEL1Q9NZ71 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RTEL1Q9NZ71 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RTEL1Q9NZ71 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RTEL1Q9NZ71 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
RTEL1Q9NZ71 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RTEL1Q9NZ71 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RTEL1Q9NZ71 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RTEL1Q9NZ71 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RTEL1Q9NZ71 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RTEL1Q9NZ71 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RTEL1Q9NZ71 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
RTEL1Q9NZ71 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RTEL1Q9NZ71 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RTEL1Q9NZ71 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RTEL1Q9NZ71 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RTEL1Q9NZ71 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RTEL1Q9NZ71 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RTEL1Q9NZ71 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
RTEL1Q9NZ71 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RTEL1Q9NZ71 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RTEL1Q9NZ71 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RTEL1Q9NZ71 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RTEL1Q9NZ71 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RTEL1Q9NZ71 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RTEL1Q9NZ71 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RTEL1Q9NZ71 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RTEL1Q9NZ71 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RTEL1Q9NZ71 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RTEL1Q9NZ71 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RTEL1Q9NZ71 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RTEL1Q9NZ71 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RTEL1Q9NZ71 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RTEL1Q9NZ71 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RTEL1Q9NZ71 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RTEL1Q9NZ71 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RTEL1Q9NZ71 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RTEL1Q9NZ71 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RTEL1Q9NZ71 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RTEL1Q9NZ71 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RTEL1Q9NZ71 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RTEL1Q9NZ71 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
RTEL1Q9NZ71 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RTEL1Q9NZ71 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RTEL1Q9NZ71 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RTEL1Q9NZ71 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RTEL1Q9NZ71 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RTEL1Q9NZ71 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RTEL1Q9NZ71 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RTEL1Q9NZ71 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RTEL1Q9NZ71 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RTEL1Q9NZ71 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RTEL1Q9NZ71 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RTEL1Q9NZ71 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RTEL1Q9NZ71 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RTEL1Q9NZ71 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RTEL1Q9NZ71 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RTEL1Q9NZ71 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RTEL1Q9NZ71 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RTEL1Q9NZ71 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RTEL1Q9NZ71 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RTEL1Q9NZ71 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RTEL1Q9NZ71 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RTEL1Q9NZ71 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RTEL1Q9NZ71 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RTEL1Q9NZ71 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
RTEL1Q9NZ71 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RTEL1Q9NZ71 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RTEL1Q9NZ71 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RTEL1Q9NZ71 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms