Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYG8

KCNK4, Potassium channel subfamily K member 4, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNK4Q9NYG8 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KCNK4Q9NYG8 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
KCNK4Q9NYG8 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
KCNK4Q9NYG8 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC21.28■■□□□ 1
KCNK4Q9NYG8 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KCNK4Q9NYG8 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KCNK4Q9NYG8 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
KCNK4Q9NYG8 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KCNK4Q9NYG8 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC21.27■■□□□ 1
KCNK4Q9NYG8 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
KCNK4Q9NYG8 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
KCNK4Q9NYG8 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
KCNK4Q9NYG8 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC21.27■■□□□ 1
KCNK4Q9NYG8 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
KCNK4Q9NYG8 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
KCNK4Q9NYG8 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC21.27■■□□□ 1
KCNK4Q9NYG8 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
KCNK4Q9NYG8 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
KCNK4Q9NYG8 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KCNK4Q9NYG8 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KCNK4Q9NYG8 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
KCNK4Q9NYG8 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
KCNK4Q9NYG8 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KCNK4Q9NYG8 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
KCNK4Q9NYG8 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
KCNK4Q9NYG8 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
KCNK4Q9NYG8 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
KCNK4Q9NYG8 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
KCNK4Q9NYG8 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
KCNK4Q9NYG8 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
KCNK4Q9NYG8 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KCNK4Q9NYG8 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KCNK4Q9NYG8 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
KCNK4Q9NYG8 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
KCNK4Q9NYG8 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
KCNK4Q9NYG8 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
KCNK4Q9NYG8 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
KCNK4Q9NYG8 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
KCNK4Q9NYG8 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
KCNK4Q9NYG8 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
KCNK4Q9NYG8 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
KCNK4Q9NYG8 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
KCNK4Q9NYG8 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
KCNK4Q9NYG8 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
KCNK4Q9NYG8 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
KCNK4Q9NYG8 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
KCNK4Q9NYG8 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
KCNK4Q9NYG8 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
KCNK4Q9NYG8 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
KCNK4Q9NYG8 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
KCNK4Q9NYG8 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
KCNK4Q9NYG8 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
KCNK4Q9NYG8 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
KCNK4Q9NYG8 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
KCNK4Q9NYG8 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
KCNK4Q9NYG8 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
KCNK4Q9NYG8 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
KCNK4Q9NYG8 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
KCNK4Q9NYG8 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
KCNK4Q9NYG8 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
KCNK4Q9NYG8 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
KCNK4Q9NYG8 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
KCNK4Q9NYG8 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
KCNK4Q9NYG8 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
KCNK4Q9NYG8 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
KCNK4Q9NYG8 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
KCNK4Q9NYG8 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
KCNK4Q9NYG8 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
KCNK4Q9NYG8 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
KCNK4Q9NYG8 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
KCNK4Q9NYG8 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
KCNK4Q9NYG8 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
KCNK4Q9NYG8 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
KCNK4Q9NYG8 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
KCNK4Q9NYG8 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
KCNK4Q9NYG8 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
KCNK4Q9NYG8 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
KCNK4Q9NYG8 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
KCNK4Q9NYG8 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
KCNK4Q9NYG8 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
KCNK4Q9NYG8 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
KCNK4Q9NYG8 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
KCNK4Q9NYG8 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
KCNK4Q9NYG8 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
KCNK4Q9NYG8 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
KCNK4Q9NYG8 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
KCNK4Q9NYG8 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
KCNK4Q9NYG8 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
KCNK4Q9NYG8 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
KCNK4Q9NYG8 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
KCNK4Q9NYG8 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
KCNK4Q9NYG8 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
KCNK4Q9NYG8 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
KCNK4Q9NYG8 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
KCNK4Q9NYG8 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
KCNK4Q9NYG8 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
KCNK4Q9NYG8 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
KCNK4Q9NYG8 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
KCNK4Q9NYG8 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
KCNK4Q9NYG8 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms