Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY43

BARHL2, BarH-like 2 homeobox protein, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BARHL2Q9NY43 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
BARHL2Q9NY43 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
BARHL2Q9NY43 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
BARHL2Q9NY43 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
BARHL2Q9NY43 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
BARHL2Q9NY43 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
BARHL2Q9NY43 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
BARHL2Q9NY43 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
BARHL2Q9NY43 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
BARHL2Q9NY43 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
BARHL2Q9NY43 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
BARHL2Q9NY43 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
BARHL2Q9NY43 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
BARHL2Q9NY43 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
BARHL2Q9NY43 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
BARHL2Q9NY43 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
BARHL2Q9NY43 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
BARHL2Q9NY43 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
BARHL2Q9NY43 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
BARHL2Q9NY43 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
BARHL2Q9NY43 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
BARHL2Q9NY43 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
BARHL2Q9NY43 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
BARHL2Q9NY43 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
BARHL2Q9NY43 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
BARHL2Q9NY43 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
BARHL2Q9NY43 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
BARHL2Q9NY43 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
BARHL2Q9NY43 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
BARHL2Q9NY43 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
BARHL2Q9NY43 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
BARHL2Q9NY43 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
BARHL2Q9NY43 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
BARHL2Q9NY43 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
BARHL2Q9NY43 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
BARHL2Q9NY43 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
BARHL2Q9NY43 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
BARHL2Q9NY43 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
BARHL2Q9NY43 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
BARHL2Q9NY43 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
BARHL2Q9NY43 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
BARHL2Q9NY43 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
BARHL2Q9NY43 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
BARHL2Q9NY43 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
BARHL2Q9NY43 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
BARHL2Q9NY43 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
BARHL2Q9NY43 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
BARHL2Q9NY43 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
BARHL2Q9NY43 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
BARHL2Q9NY43 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
BARHL2Q9NY43 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
BARHL2Q9NY43 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
BARHL2Q9NY43 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
BARHL2Q9NY43 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
BARHL2Q9NY43 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
BARHL2Q9NY43 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
BARHL2Q9NY43 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
BARHL2Q9NY43 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
BARHL2Q9NY43 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
BARHL2Q9NY43 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
BARHL2Q9NY43 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
BARHL2Q9NY43 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
BARHL2Q9NY43 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
BARHL2Q9NY43 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
BARHL2Q9NY43 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
BARHL2Q9NY43 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
BARHL2Q9NY43 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
BARHL2Q9NY43 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
BARHL2Q9NY43 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
BARHL2Q9NY43 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
BARHL2Q9NY43 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
BARHL2Q9NY43 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
BARHL2Q9NY43 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
BARHL2Q9NY43 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
BARHL2Q9NY43 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
BARHL2Q9NY43 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
BARHL2Q9NY43 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
BARHL2Q9NY43 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
BARHL2Q9NY43 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
BARHL2Q9NY43 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
BARHL2Q9NY43 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
BARHL2Q9NY43 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
BARHL2Q9NY43 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
BARHL2Q9NY43 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
BARHL2Q9NY43 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
BARHL2Q9NY43 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
BARHL2Q9NY43 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
BARHL2Q9NY43 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
BARHL2Q9NY43 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
BARHL2Q9NY43 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
BARHL2Q9NY43 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
BARHL2Q9NY43 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
BARHL2Q9NY43 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
BARHL2Q9NY43 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
BARHL2Q9NY43 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
BARHL2Q9NY43 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
BARHL2Q9NY43 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
BARHL2Q9NY43 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
BARHL2Q9NY43 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
BARHL2Q9NY43 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms