Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXZ2

DDX43, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX43, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX43Q9NXZ2 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
DDX43Q9NXZ2 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
DDX43Q9NXZ2 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
DDX43Q9NXZ2 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
DDX43Q9NXZ2 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
DDX43Q9NXZ2 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
DDX43Q9NXZ2 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
DDX43Q9NXZ2 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DDX43Q9NXZ2 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DDX43Q9NXZ2 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
DDX43Q9NXZ2 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DDX43Q9NXZ2 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DDX43Q9NXZ2 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
DDX43Q9NXZ2 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DDX43Q9NXZ2 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
DDX43Q9NXZ2 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
DDX43Q9NXZ2 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DDX43Q9NXZ2 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DDX43Q9NXZ2 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DDX43Q9NXZ2 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
DDX43Q9NXZ2 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
DDX43Q9NXZ2 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DDX43Q9NXZ2 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
DDX43Q9NXZ2 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
DDX43Q9NXZ2 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
DDX43Q9NXZ2 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
DDX43Q9NXZ2 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
DDX43Q9NXZ2 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
DDX43Q9NXZ2 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
DDX43Q9NXZ2 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
DDX43Q9NXZ2 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
DDX43Q9NXZ2 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
DDX43Q9NXZ2 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
DDX43Q9NXZ2 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
DDX43Q9NXZ2 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
DDX43Q9NXZ2 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
DDX43Q9NXZ2 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
DDX43Q9NXZ2 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
DDX43Q9NXZ2 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
DDX43Q9NXZ2 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
DDX43Q9NXZ2 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
DDX43Q9NXZ2 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
DDX43Q9NXZ2 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
DDX43Q9NXZ2 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
DDX43Q9NXZ2 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
DDX43Q9NXZ2 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
DDX43Q9NXZ2 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
DDX43Q9NXZ2 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
DDX43Q9NXZ2 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
DDX43Q9NXZ2 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
DDX43Q9NXZ2 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
DDX43Q9NXZ2 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
DDX43Q9NXZ2 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
DDX43Q9NXZ2 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
DDX43Q9NXZ2 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
DDX43Q9NXZ2 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
DDX43Q9NXZ2 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
DDX43Q9NXZ2 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
DDX43Q9NXZ2 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
DDX43Q9NXZ2 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
DDX43Q9NXZ2 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
DDX43Q9NXZ2 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
DDX43Q9NXZ2 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
DDX43Q9NXZ2 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
DDX43Q9NXZ2 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DDX43Q9NXZ2 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DDX43Q9NXZ2 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
DDX43Q9NXZ2 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
DDX43Q9NXZ2 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
DDX43Q9NXZ2 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
DDX43Q9NXZ2 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DDX43Q9NXZ2 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
DDX43Q9NXZ2 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DDX43Q9NXZ2 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DDX43Q9NXZ2 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DDX43Q9NXZ2 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
DDX43Q9NXZ2 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
DDX43Q9NXZ2 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
DDX43Q9NXZ2 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
DDX43Q9NXZ2 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
DDX43Q9NXZ2 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
DDX43Q9NXZ2 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
DDX43Q9NXZ2 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
DDX43Q9NXZ2 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
DDX43Q9NXZ2 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
DDX43Q9NXZ2 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
DDX43Q9NXZ2 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
DDX43Q9NXZ2 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
DDX43Q9NXZ2 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
DDX43Q9NXZ2 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
DDX43Q9NXZ2 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
DDX43Q9NXZ2 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
DDX43Q9NXZ2 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
DDX43Q9NXZ2 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
DDX43Q9NXZ2 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
DDX43Q9NXZ2 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
DDX43Q9NXZ2 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
DDX43Q9NXZ2 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
DDX43Q9NXZ2 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
DDX43Q9NXZ2 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms