Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXL9

MCM9, DNA helicase MCM9, humanhuman

Predictions only

Length 1,143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCM9Q9NXL9 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
MCM9Q9NXL9 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
MCM9Q9NXL9 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
MCM9Q9NXL9 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
MCM9Q9NXL9 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
MCM9Q9NXL9 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
MCM9Q9NXL9 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
MCM9Q9NXL9 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
MCM9Q9NXL9 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
MCM9Q9NXL9 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
MCM9Q9NXL9 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
MCM9Q9NXL9 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
MCM9Q9NXL9 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
MCM9Q9NXL9 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
MCM9Q9NXL9 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
MCM9Q9NXL9 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
MCM9Q9NXL9 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
MCM9Q9NXL9 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
MCM9Q9NXL9 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
MCM9Q9NXL9 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
MCM9Q9NXL9 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
MCM9Q9NXL9 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
MCM9Q9NXL9 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MCM9Q9NXL9 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
MCM9Q9NXL9 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC25.05■■□□□ 1.6
MCM9Q9NXL9 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MCM9Q9NXL9 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
MCM9Q9NXL9 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MCM9Q9NXL9 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MCM9Q9NXL9 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
MCM9Q9NXL9 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MCM9Q9NXL9 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MCM9Q9NXL9 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
MCM9Q9NXL9 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MCM9Q9NXL9 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
MCM9Q9NXL9 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
MCM9Q9NXL9 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
MCM9Q9NXL9 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MCM9Q9NXL9 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MCM9Q9NXL9 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MCM9Q9NXL9 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MCM9Q9NXL9 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MCM9Q9NXL9 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MCM9Q9NXL9 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MCM9Q9NXL9 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MCM9Q9NXL9 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MCM9Q9NXL9 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
MCM9Q9NXL9 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
MCM9Q9NXL9 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MCM9Q9NXL9 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
MCM9Q9NXL9 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
MCM9Q9NXL9 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MCM9Q9NXL9 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
MCM9Q9NXL9 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MCM9Q9NXL9 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MCM9Q9NXL9 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MCM9Q9NXL9 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MCM9Q9NXL9 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MCM9Q9NXL9 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MCM9Q9NXL9 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MCM9Q9NXL9 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
MCM9Q9NXL9 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
MCM9Q9NXL9 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MCM9Q9NXL9 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
MCM9Q9NXL9 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MCM9Q9NXL9 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
MCM9Q9NXL9 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
MCM9Q9NXL9 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
MCM9Q9NXL9 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
MCM9Q9NXL9 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
MCM9Q9NXL9 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MCM9Q9NXL9 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
MCM9Q9NXL9 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
MCM9Q9NXL9 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
MCM9Q9NXL9 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
MCM9Q9NXL9 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MCM9Q9NXL9 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
MCM9Q9NXL9 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
MCM9Q9NXL9 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
MCM9Q9NXL9 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
MCM9Q9NXL9 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
MCM9Q9NXL9 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
MCM9Q9NXL9 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
MCM9Q9NXL9 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
MCM9Q9NXL9 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
MCM9Q9NXL9 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MCM9Q9NXL9 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MCM9Q9NXL9 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MCM9Q9NXL9 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MCM9Q9NXL9 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC25■■□□□ 1.59
MCM9Q9NXL9 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
MCM9Q9NXL9 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
MCM9Q9NXL9 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
MCM9Q9NXL9 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
MCM9Q9NXL9 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
MCM9Q9NXL9 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MCM9Q9NXL9 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MCM9Q9NXL9 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
MCM9Q9NXL9 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC25■■□□□ 1.59
MCM9Q9NXL9 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms