Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVM6

DNAJC17, DnaJ homolog subfamily C member 17, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJC17Q9NVM6 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DNAJC17Q9NVM6 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DNAJC17Q9NVM6 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
DNAJC17Q9NVM6 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
DNAJC17Q9NVM6 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DNAJC17Q9NVM6 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
DNAJC17Q9NVM6 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
DNAJC17Q9NVM6 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
DNAJC17Q9NVM6 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
DNAJC17Q9NVM6 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
DNAJC17Q9NVM6 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
DNAJC17Q9NVM6 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
DNAJC17Q9NVM6 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
DNAJC17Q9NVM6 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
DNAJC17Q9NVM6 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
DNAJC17Q9NVM6 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DNAJC17Q9NVM6 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
DNAJC17Q9NVM6 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
DNAJC17Q9NVM6 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
DNAJC17Q9NVM6 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DNAJC17Q9NVM6 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DNAJC17Q9NVM6 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
DNAJC17Q9NVM6 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
DNAJC17Q9NVM6 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DNAJC17Q9NVM6 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DNAJC17Q9NVM6 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
DNAJC17Q9NVM6 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
DNAJC17Q9NVM6 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DNAJC17Q9NVM6 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
DNAJC17Q9NVM6 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DNAJC17Q9NVM6 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DNAJC17Q9NVM6 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DNAJC17Q9NVM6 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DNAJC17Q9NVM6 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DNAJC17Q9NVM6 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
DNAJC17Q9NVM6 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
DNAJC17Q9NVM6 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
DNAJC17Q9NVM6 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
DNAJC17Q9NVM6 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DNAJC17Q9NVM6 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
DNAJC17Q9NVM6 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
DNAJC17Q9NVM6 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
DNAJC17Q9NVM6 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
DNAJC17Q9NVM6 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
DNAJC17Q9NVM6 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
DNAJC17Q9NVM6 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
DNAJC17Q9NVM6 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
DNAJC17Q9NVM6 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
DNAJC17Q9NVM6 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
DNAJC17Q9NVM6 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
DNAJC17Q9NVM6 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
DNAJC17Q9NVM6 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DNAJC17Q9NVM6 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
DNAJC17Q9NVM6 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DNAJC17Q9NVM6 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
DNAJC17Q9NVM6 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
DNAJC17Q9NVM6 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DNAJC17Q9NVM6 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DNAJC17Q9NVM6 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
DNAJC17Q9NVM6 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
DNAJC17Q9NVM6 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
DNAJC17Q9NVM6 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
DNAJC17Q9NVM6 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
DNAJC17Q9NVM6 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DNAJC17Q9NVM6 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
DNAJC17Q9NVM6 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
DNAJC17Q9NVM6 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DNAJC17Q9NVM6 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
DNAJC17Q9NVM6 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
DNAJC17Q9NVM6 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
DNAJC17Q9NVM6 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DNAJC17Q9NVM6 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
DNAJC17Q9NVM6 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
DNAJC17Q9NVM6 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
DNAJC17Q9NVM6 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
DNAJC17Q9NVM6 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
DNAJC17Q9NVM6 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
DNAJC17Q9NVM6 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
DNAJC17Q9NVM6 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
DNAJC17Q9NVM6 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
DNAJC17Q9NVM6 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
DNAJC17Q9NVM6 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
DNAJC17Q9NVM6 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
DNAJC17Q9NVM6 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
DNAJC17Q9NVM6 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
DNAJC17Q9NVM6 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
DNAJC17Q9NVM6 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
DNAJC17Q9NVM6 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
DNAJC17Q9NVM6 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
DNAJC17Q9NVM6 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
DNAJC17Q9NVM6 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
DNAJC17Q9NVM6 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
DNAJC17Q9NVM6 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
DNAJC17Q9NVM6 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
DNAJC17Q9NVM6 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
DNAJC17Q9NVM6 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
DNAJC17Q9NVM6 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
DNAJC17Q9NVM6 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
DNAJC17Q9NVM6 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
DNAJC17Q9NVM6 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms