Protein–RNA interactions for Protein: Q9NU53

GINM1, Glycoprotein integral membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINM1Q9NU53 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
GINM1Q9NU53 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GINM1Q9NU53 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
GINM1Q9NU53 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GINM1Q9NU53 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GINM1Q9NU53 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GINM1Q9NU53 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GINM1Q9NU53 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GINM1Q9NU53 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GINM1Q9NU53 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GINM1Q9NU53 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GINM1Q9NU53 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GINM1Q9NU53 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GINM1Q9NU53 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GINM1Q9NU53 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GINM1Q9NU53 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GINM1Q9NU53 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GINM1Q9NU53 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GINM1Q9NU53 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GINM1Q9NU53 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GINM1Q9NU53 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GINM1Q9NU53 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GINM1Q9NU53 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GINM1Q9NU53 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GINM1Q9NU53 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GINM1Q9NU53 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GINM1Q9NU53 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GINM1Q9NU53 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GINM1Q9NU53 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
GINM1Q9NU53 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
GINM1Q9NU53 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GINM1Q9NU53 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GINM1Q9NU53 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
GINM1Q9NU53 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GINM1Q9NU53 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GINM1Q9NU53 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GINM1Q9NU53 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GINM1Q9NU53 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GINM1Q9NU53 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GINM1Q9NU53 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GINM1Q9NU53 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GINM1Q9NU53 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GINM1Q9NU53 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
GINM1Q9NU53 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
GINM1Q9NU53 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC24.58■■□□□ 1.53
GINM1Q9NU53 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC24.58■■□□□ 1.53
GINM1Q9NU53 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
GINM1Q9NU53 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GINM1Q9NU53 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
GINM1Q9NU53 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
GINM1Q9NU53 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
GINM1Q9NU53 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GINM1Q9NU53 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GINM1Q9NU53 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GINM1Q9NU53 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GINM1Q9NU53 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GINM1Q9NU53 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GINM1Q9NU53 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GINM1Q9NU53 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GINM1Q9NU53 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
GINM1Q9NU53 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GINM1Q9NU53 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GINM1Q9NU53 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GINM1Q9NU53 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GINM1Q9NU53 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GINM1Q9NU53 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GINM1Q9NU53 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GINM1Q9NU53 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GINM1Q9NU53 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GINM1Q9NU53 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GINM1Q9NU53 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GINM1Q9NU53 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GINM1Q9NU53 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GINM1Q9NU53 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GINM1Q9NU53 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GINM1Q9NU53 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GINM1Q9NU53 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GINM1Q9NU53 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GINM1Q9NU53 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GINM1Q9NU53 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GINM1Q9NU53 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GINM1Q9NU53 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GINM1Q9NU53 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GINM1Q9NU53 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GINM1Q9NU53 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GINM1Q9NU53 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GINM1Q9NU53 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
GINM1Q9NU53 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GINM1Q9NU53 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GINM1Q9NU53 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GINM1Q9NU53 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GINM1Q9NU53 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GINM1Q9NU53 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GINM1Q9NU53 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GINM1Q9NU53 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GINM1Q9NU53 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GINM1Q9NU53 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GINM1Q9NU53 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GINM1Q9NU53 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GINM1Q9NU53 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.5 ms