Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTQ9

GJB4, Gap junction beta-4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB4Q9NTQ9 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GJB4Q9NTQ9 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GJB4Q9NTQ9 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GJB4Q9NTQ9 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GJB4Q9NTQ9 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GJB4Q9NTQ9 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GJB4Q9NTQ9 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GJB4Q9NTQ9 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GJB4Q9NTQ9 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GJB4Q9NTQ9 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GJB4Q9NTQ9 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
GJB4Q9NTQ9 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GJB4Q9NTQ9 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GJB4Q9NTQ9 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GJB4Q9NTQ9 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GJB4Q9NTQ9 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GJB4Q9NTQ9 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GJB4Q9NTQ9 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GJB4Q9NTQ9 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GJB4Q9NTQ9 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GJB4Q9NTQ9 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GJB4Q9NTQ9 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GJB4Q9NTQ9 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GJB4Q9NTQ9 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GJB4Q9NTQ9 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
GJB4Q9NTQ9 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GJB4Q9NTQ9 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GJB4Q9NTQ9 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GJB4Q9NTQ9 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GJB4Q9NTQ9 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GJB4Q9NTQ9 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GJB4Q9NTQ9 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GJB4Q9NTQ9 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GJB4Q9NTQ9 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GJB4Q9NTQ9 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GJB4Q9NTQ9 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
GJB4Q9NTQ9 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GJB4Q9NTQ9 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GJB4Q9NTQ9 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GJB4Q9NTQ9 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GJB4Q9NTQ9 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GJB4Q9NTQ9 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GJB4Q9NTQ9 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
GJB4Q9NTQ9 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
GJB4Q9NTQ9 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GJB4Q9NTQ9 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GJB4Q9NTQ9 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GJB4Q9NTQ9 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GJB4Q9NTQ9 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GJB4Q9NTQ9 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GJB4Q9NTQ9 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GJB4Q9NTQ9 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GJB4Q9NTQ9 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GJB4Q9NTQ9 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GJB4Q9NTQ9 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GJB4Q9NTQ9 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GJB4Q9NTQ9 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GJB4Q9NTQ9 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GJB4Q9NTQ9 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GJB4Q9NTQ9 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GJB4Q9NTQ9 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GJB4Q9NTQ9 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GJB4Q9NTQ9 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GJB4Q9NTQ9 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GJB4Q9NTQ9 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GJB4Q9NTQ9 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GJB4Q9NTQ9 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
GJB4Q9NTQ9 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GJB4Q9NTQ9 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
GJB4Q9NTQ9 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
GJB4Q9NTQ9 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
GJB4Q9NTQ9 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
GJB4Q9NTQ9 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
GJB4Q9NTQ9 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
GJB4Q9NTQ9 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
GJB4Q9NTQ9 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GJB4Q9NTQ9 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
GJB4Q9NTQ9 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
GJB4Q9NTQ9 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GJB4Q9NTQ9 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GJB4Q9NTQ9 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GJB4Q9NTQ9 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GJB4Q9NTQ9 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
GJB4Q9NTQ9 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GJB4Q9NTQ9 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GJB4Q9NTQ9 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GJB4Q9NTQ9 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GJB4Q9NTQ9 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GJB4Q9NTQ9 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GJB4Q9NTQ9 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GJB4Q9NTQ9 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GJB4Q9NTQ9 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GJB4Q9NTQ9 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GJB4Q9NTQ9 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GJB4Q9NTQ9 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GJB4Q9NTQ9 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GJB4Q9NTQ9 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GJB4Q9NTQ9 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GJB4Q9NTQ9 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GJB4Q9NTQ9 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms