Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSD4

ZNF275, Zinc finger protein 275, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 429 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF275Q9NSD4 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ZNF275Q9NSD4 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ZNF275Q9NSD4 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ZNF275Q9NSD4 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
ZNF275Q9NSD4 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ZNF275Q9NSD4 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ZNF275Q9NSD4 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ZNF275Q9NSD4 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ZNF275Q9NSD4 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ZNF275Q9NSD4 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
ZNF275Q9NSD4 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ZNF275Q9NSD4 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
ZNF275Q9NSD4 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ZNF275Q9NSD4 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
ZNF275Q9NSD4 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
ZNF275Q9NSD4 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ZNF275Q9NSD4 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ZNF275Q9NSD4 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ZNF275Q9NSD4 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ZNF275Q9NSD4 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ZNF275Q9NSD4 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ZNF275Q9NSD4 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ZNF275Q9NSD4 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ZNF275Q9NSD4 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ZNF275Q9NSD4 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ZNF275Q9NSD4 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ZNF275Q9NSD4 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ZNF275Q9NSD4 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ZNF275Q9NSD4 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
ZNF275Q9NSD4 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ZNF275Q9NSD4 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ZNF275Q9NSD4 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ZNF275Q9NSD4 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ZNF275Q9NSD4 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ZNF275Q9NSD4 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ZNF275Q9NSD4 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ZNF275Q9NSD4 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ZNF275Q9NSD4 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ZNF275Q9NSD4 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ZNF275Q9NSD4 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ZNF275Q9NSD4 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ZNF275Q9NSD4 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ZNF275Q9NSD4 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ZNF275Q9NSD4 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ZNF275Q9NSD4 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ZNF275Q9NSD4 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ZNF275Q9NSD4 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ZNF275Q9NSD4 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ZNF275Q9NSD4 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ZNF275Q9NSD4 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ZNF275Q9NSD4 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ZNF275Q9NSD4 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ZNF275Q9NSD4 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ZNF275Q9NSD4 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ZNF275Q9NSD4 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ZNF275Q9NSD4 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ZNF275Q9NSD4 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ZNF275Q9NSD4 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
ZNF275Q9NSD4 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
ZNF275Q9NSD4 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ZNF275Q9NSD4 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ZNF275Q9NSD4 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ZNF275Q9NSD4 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ZNF275Q9NSD4 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ZNF275Q9NSD4 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ZNF275Q9NSD4 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ZNF275Q9NSD4 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ZNF275Q9NSD4 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
ZNF275Q9NSD4 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ZNF275Q9NSD4 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ZNF275Q9NSD4 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ZNF275Q9NSD4 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
ZNF275Q9NSD4 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
ZNF275Q9NSD4 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ZNF275Q9NSD4 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ZNF275Q9NSD4 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ZNF275Q9NSD4 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ZNF275Q9NSD4 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ZNF275Q9NSD4 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZNF275Q9NSD4 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZNF275Q9NSD4 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZNF275Q9NSD4 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZNF275Q9NSD4 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZNF275Q9NSD4 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZNF275Q9NSD4 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZNF275Q9NSD4 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZNF275Q9NSD4 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZNF275Q9NSD4 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZNF275Q9NSD4 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZNF275Q9NSD4 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZNF275Q9NSD4 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZNF275Q9NSD4 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZNF275Q9NSD4 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZNF275Q9NSD4 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZNF275Q9NSD4 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZNF275Q9NSD4 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZNF275Q9NSD4 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZNF275Q9NSD4 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZNF275Q9NSD4 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZNF275Q9NSD4 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms