Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS98

SEMA3G, Semaphorin-3G, humanhuman

Predictions only

Length 782 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3GQ9NS98 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SEMA3GQ9NS98 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SEMA3GQ9NS98 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SEMA3GQ9NS98 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SEMA3GQ9NS98 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SEMA3GQ9NS98 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SEMA3GQ9NS98 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SEMA3GQ9NS98 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SEMA3GQ9NS98 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SEMA3GQ9NS98 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SEMA3GQ9NS98 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SEMA3GQ9NS98 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
SEMA3GQ9NS98 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SEMA3GQ9NS98 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SEMA3GQ9NS98 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SEMA3GQ9NS98 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SEMA3GQ9NS98 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SEMA3GQ9NS98 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SEMA3GQ9NS98 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SEMA3GQ9NS98 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SEMA3GQ9NS98 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SEMA3GQ9NS98 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SEMA3GQ9NS98 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SEMA3GQ9NS98 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SEMA3GQ9NS98 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SEMA3GQ9NS98 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SEMA3GQ9NS98 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SEMA3GQ9NS98 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SEMA3GQ9NS98 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SEMA3GQ9NS98 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
SEMA3GQ9NS98 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SEMA3GQ9NS98 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SEMA3GQ9NS98 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SEMA3GQ9NS98 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SEMA3GQ9NS98 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SEMA3GQ9NS98 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SEMA3GQ9NS98 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SEMA3GQ9NS98 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SEMA3GQ9NS98 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SEMA3GQ9NS98 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SEMA3GQ9NS98 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SEMA3GQ9NS98 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SEMA3GQ9NS98 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
SEMA3GQ9NS98 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SEMA3GQ9NS98 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SEMA3GQ9NS98 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SEMA3GQ9NS98 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SEMA3GQ9NS98 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SEMA3GQ9NS98 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SEMA3GQ9NS98 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SEMA3GQ9NS98 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SEMA3GQ9NS98 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SEMA3GQ9NS98 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SEMA3GQ9NS98 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SEMA3GQ9NS98 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SEMA3GQ9NS98 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SEMA3GQ9NS98 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SEMA3GQ9NS98 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SEMA3GQ9NS98 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SEMA3GQ9NS98 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SEMA3GQ9NS98 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SEMA3GQ9NS98 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SEMA3GQ9NS98 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SEMA3GQ9NS98 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SEMA3GQ9NS98 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SEMA3GQ9NS98 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SEMA3GQ9NS98 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SEMA3GQ9NS98 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SEMA3GQ9NS98 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SEMA3GQ9NS98 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SEMA3GQ9NS98 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SEMA3GQ9NS98 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SEMA3GQ9NS98 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SEMA3GQ9NS98 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SEMA3GQ9NS98 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SEMA3GQ9NS98 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SEMA3GQ9NS98 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SEMA3GQ9NS98 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SEMA3GQ9NS98 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SEMA3GQ9NS98 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SEMA3GQ9NS98 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SEMA3GQ9NS98 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
SEMA3GQ9NS98 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SEMA3GQ9NS98 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SEMA3GQ9NS98 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SEMA3GQ9NS98 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SEMA3GQ9NS98 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
SEMA3GQ9NS98 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SEMA3GQ9NS98 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SEMA3GQ9NS98 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SEMA3GQ9NS98 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SEMA3GQ9NS98 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SEMA3GQ9NS98 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SEMA3GQ9NS98 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SEMA3GQ9NS98 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
SEMA3GQ9NS98 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SEMA3GQ9NS98 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SEMA3GQ9NS98 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SEMA3GQ9NS98 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SEMA3GQ9NS98 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms