Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS71

GKN1, Gastrokine-1, humanhuman

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Length 199 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GKN1Q9NS71 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GKN1Q9NS71 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GKN1Q9NS71 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GKN1Q9NS71 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GKN1Q9NS71 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GKN1Q9NS71 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GKN1Q9NS71 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GKN1Q9NS71 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GKN1Q9NS71 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GKN1Q9NS71 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GKN1Q9NS71 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GKN1Q9NS71 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GKN1Q9NS71 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GKN1Q9NS71 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
GKN1Q9NS71 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GKN1Q9NS71 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GKN1Q9NS71 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GKN1Q9NS71 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GKN1Q9NS71 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GKN1Q9NS71 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
GKN1Q9NS71 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GKN1Q9NS71 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
GKN1Q9NS71 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
GKN1Q9NS71 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GKN1Q9NS71 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GKN1Q9NS71 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GKN1Q9NS71 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GKN1Q9NS71 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GKN1Q9NS71 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GKN1Q9NS71 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
GKN1Q9NS71 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GKN1Q9NS71 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GKN1Q9NS71 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
GKN1Q9NS71 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GKN1Q9NS71 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GKN1Q9NS71 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GKN1Q9NS71 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GKN1Q9NS71 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GKN1Q9NS71 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
GKN1Q9NS71 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GKN1Q9NS71 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GKN1Q9NS71 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GKN1Q9NS71 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GKN1Q9NS71 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GKN1Q9NS71 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GKN1Q9NS71 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GKN1Q9NS71 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GKN1Q9NS71 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GKN1Q9NS71 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GKN1Q9NS71 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GKN1Q9NS71 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GKN1Q9NS71 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GKN1Q9NS71 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GKN1Q9NS71 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GKN1Q9NS71 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GKN1Q9NS71 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GKN1Q9NS71 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GKN1Q9NS71 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GKN1Q9NS71 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GKN1Q9NS71 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GKN1Q9NS71 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GKN1Q9NS71 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GKN1Q9NS71 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
GKN1Q9NS71 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GKN1Q9NS71 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GKN1Q9NS71 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GKN1Q9NS71 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GKN1Q9NS71 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GKN1Q9NS71 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GKN1Q9NS71 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GKN1Q9NS71 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
GKN1Q9NS71 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
GKN1Q9NS71 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GKN1Q9NS71 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GKN1Q9NS71 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
GKN1Q9NS71 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
GKN1Q9NS71 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
GKN1Q9NS71 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
GKN1Q9NS71 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
GKN1Q9NS71 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GKN1Q9NS71 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GKN1Q9NS71 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GKN1Q9NS71 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GKN1Q9NS71 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GKN1Q9NS71 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GKN1Q9NS71 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GKN1Q9NS71 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GKN1Q9NS71 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GKN1Q9NS71 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GKN1Q9NS71 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GKN1Q9NS71 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GKN1Q9NS71 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GKN1Q9NS71 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GKN1Q9NS71 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GKN1Q9NS71 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GKN1Q9NS71 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GKN1Q9NS71 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GKN1Q9NS71 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GKN1Q9NS71 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GKN1Q9NS71 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
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