Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRS4

TMPRSS4, Transmembrane protease serine 4, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPRSS4Q9NRS4 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TMPRSS4Q9NRS4 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TMPRSS4Q9NRS4 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TMPRSS4Q9NRS4 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TMPRSS4Q9NRS4 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TMPRSS4Q9NRS4 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TMPRSS4Q9NRS4 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TMPRSS4Q9NRS4 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
TMPRSS4Q9NRS4 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TMPRSS4Q9NRS4 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TMPRSS4Q9NRS4 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TMPRSS4Q9NRS4 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TMPRSS4Q9NRS4 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TMPRSS4Q9NRS4 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TMPRSS4Q9NRS4 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TMPRSS4Q9NRS4 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TMPRSS4Q9NRS4 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TMPRSS4Q9NRS4 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TMPRSS4Q9NRS4 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TMPRSS4Q9NRS4 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TMPRSS4Q9NRS4 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TMPRSS4Q9NRS4 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
TMPRSS4Q9NRS4 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TMPRSS4Q9NRS4 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TMPRSS4Q9NRS4 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TMPRSS4Q9NRS4 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TMPRSS4Q9NRS4 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TMPRSS4Q9NRS4 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TMPRSS4Q9NRS4 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TMPRSS4Q9NRS4 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TMPRSS4Q9NRS4 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TMPRSS4Q9NRS4 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
TMPRSS4Q9NRS4 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TMPRSS4Q9NRS4 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TMPRSS4Q9NRS4 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TMPRSS4Q9NRS4 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TMPRSS4Q9NRS4 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TMPRSS4Q9NRS4 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TMPRSS4Q9NRS4 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TMPRSS4Q9NRS4 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TMPRSS4Q9NRS4 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TMPRSS4Q9NRS4 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TMPRSS4Q9NRS4 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TMPRSS4Q9NRS4 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TMPRSS4Q9NRS4 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TMPRSS4Q9NRS4 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TMPRSS4Q9NRS4 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TMPRSS4Q9NRS4 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TMPRSS4Q9NRS4 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TMPRSS4Q9NRS4 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TMPRSS4Q9NRS4 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TMPRSS4Q9NRS4 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TMPRSS4Q9NRS4 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TMPRSS4Q9NRS4 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TMPRSS4Q9NRS4 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
TMPRSS4Q9NRS4 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
TMPRSS4Q9NRS4 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TMPRSS4Q9NRS4 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TMPRSS4Q9NRS4 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TMPRSS4Q9NRS4 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TMPRSS4Q9NRS4 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TMPRSS4Q9NRS4 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
TMPRSS4Q9NRS4 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TMPRSS4Q9NRS4 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
TMPRSS4Q9NRS4 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TMPRSS4Q9NRS4 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TMPRSS4Q9NRS4 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TMPRSS4Q9NRS4 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TMPRSS4Q9NRS4 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TMPRSS4Q9NRS4 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TMPRSS4Q9NRS4 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TMPRSS4Q9NRS4 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TMPRSS4Q9NRS4 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TMPRSS4Q9NRS4 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TMPRSS4Q9NRS4 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TMPRSS4Q9NRS4 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TMPRSS4Q9NRS4 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TMPRSS4Q9NRS4 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TMPRSS4Q9NRS4 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TMPRSS4Q9NRS4 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TMPRSS4Q9NRS4 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TMPRSS4Q9NRS4 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TMPRSS4Q9NRS4 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TMPRSS4Q9NRS4 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TMPRSS4Q9NRS4 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TMPRSS4Q9NRS4 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TMPRSS4Q9NRS4 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TMPRSS4Q9NRS4 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TMPRSS4Q9NRS4 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TMPRSS4Q9NRS4 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TMPRSS4Q9NRS4 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
TMPRSS4Q9NRS4 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TMPRSS4Q9NRS4 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TMPRSS4Q9NRS4 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TMPRSS4Q9NRS4 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TMPRSS4Q9NRS4 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TMPRSS4Q9NRS4 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
TMPRSS4Q9NRS4 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TMPRSS4Q9NRS4 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TMPRSS4Q9NRS4 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms