Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRJ5

PAPOLB, Poly(A) polymerase beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAPOLBQ9NRJ5 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PAPOLBQ9NRJ5 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PAPOLBQ9NRJ5 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PAPOLBQ9NRJ5 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PAPOLBQ9NRJ5 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PAPOLBQ9NRJ5 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
PAPOLBQ9NRJ5 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
PAPOLBQ9NRJ5 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PAPOLBQ9NRJ5 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PAPOLBQ9NRJ5 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PAPOLBQ9NRJ5 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
PAPOLBQ9NRJ5 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PAPOLBQ9NRJ5 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PAPOLBQ9NRJ5 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PAPOLBQ9NRJ5 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PAPOLBQ9NRJ5 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PAPOLBQ9NRJ5 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PAPOLBQ9NRJ5 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PAPOLBQ9NRJ5 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PAPOLBQ9NRJ5 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PAPOLBQ9NRJ5 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PAPOLBQ9NRJ5 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PAPOLBQ9NRJ5 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PAPOLBQ9NRJ5 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PAPOLBQ9NRJ5 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PAPOLBQ9NRJ5 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PAPOLBQ9NRJ5 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PAPOLBQ9NRJ5 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
PAPOLBQ9NRJ5 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PAPOLBQ9NRJ5 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PAPOLBQ9NRJ5 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PAPOLBQ9NRJ5 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PAPOLBQ9NRJ5 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
PAPOLBQ9NRJ5 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PAPOLBQ9NRJ5 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PAPOLBQ9NRJ5 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PAPOLBQ9NRJ5 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PAPOLBQ9NRJ5 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PAPOLBQ9NRJ5 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PAPOLBQ9NRJ5 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PAPOLBQ9NRJ5 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PAPOLBQ9NRJ5 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
PAPOLBQ9NRJ5 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PAPOLBQ9NRJ5 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PAPOLBQ9NRJ5 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PAPOLBQ9NRJ5 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
PAPOLBQ9NRJ5 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PAPOLBQ9NRJ5 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PAPOLBQ9NRJ5 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PAPOLBQ9NRJ5 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PAPOLBQ9NRJ5 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PAPOLBQ9NRJ5 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PAPOLBQ9NRJ5 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PAPOLBQ9NRJ5 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PAPOLBQ9NRJ5 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PAPOLBQ9NRJ5 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
PAPOLBQ9NRJ5 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PAPOLBQ9NRJ5 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PAPOLBQ9NRJ5 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PAPOLBQ9NRJ5 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PAPOLBQ9NRJ5 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PAPOLBQ9NRJ5 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PAPOLBQ9NRJ5 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
PAPOLBQ9NRJ5 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PAPOLBQ9NRJ5 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PAPOLBQ9NRJ5 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PAPOLBQ9NRJ5 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PAPOLBQ9NRJ5 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PAPOLBQ9NRJ5 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PAPOLBQ9NRJ5 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PAPOLBQ9NRJ5 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PAPOLBQ9NRJ5 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PAPOLBQ9NRJ5 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PAPOLBQ9NRJ5 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PAPOLBQ9NRJ5 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PAPOLBQ9NRJ5 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PAPOLBQ9NRJ5 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PAPOLBQ9NRJ5 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PAPOLBQ9NRJ5 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PAPOLBQ9NRJ5 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PAPOLBQ9NRJ5 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PAPOLBQ9NRJ5 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PAPOLBQ9NRJ5 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PAPOLBQ9NRJ5 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PAPOLBQ9NRJ5 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PAPOLBQ9NRJ5 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PAPOLBQ9NRJ5 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PAPOLBQ9NRJ5 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PAPOLBQ9NRJ5 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PAPOLBQ9NRJ5 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
PAPOLBQ9NRJ5 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PAPOLBQ9NRJ5 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PAPOLBQ9NRJ5 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PAPOLBQ9NRJ5 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PAPOLBQ9NRJ5 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PAPOLBQ9NRJ5 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PAPOLBQ9NRJ5 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PAPOLBQ9NRJ5 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PAPOLBQ9NRJ5 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PAPOLBQ9NRJ5 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms