Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQX3

GPHN, Gephyrin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPHNQ9NQX3 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GPHNQ9NQX3 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
GPHNQ9NQX3 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GPHNQ9NQX3 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GPHNQ9NQX3 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
GPHNQ9NQX3 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GPHNQ9NQX3 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
GPHNQ9NQX3 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
GPHNQ9NQX3 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GPHNQ9NQX3 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
GPHNQ9NQX3 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GPHNQ9NQX3 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GPHNQ9NQX3 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GPHNQ9NQX3 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GPHNQ9NQX3 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GPHNQ9NQX3 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GPHNQ9NQX3 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GPHNQ9NQX3 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GPHNQ9NQX3 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GPHNQ9NQX3 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
GPHNQ9NQX3 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GPHNQ9NQX3 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GPHNQ9NQX3 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GPHNQ9NQX3 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GPHNQ9NQX3 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GPHNQ9NQX3 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GPHNQ9NQX3 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GPHNQ9NQX3 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GPHNQ9NQX3 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GPHNQ9NQX3 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GPHNQ9NQX3 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GPHNQ9NQX3 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
GPHNQ9NQX3 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GPHNQ9NQX3 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GPHNQ9NQX3 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
GPHNQ9NQX3 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
GPHNQ9NQX3 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GPHNQ9NQX3 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
GPHNQ9NQX3 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GPHNQ9NQX3 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
GPHNQ9NQX3 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
GPHNQ9NQX3 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
GPHNQ9NQX3 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
GPHNQ9NQX3 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
GPHNQ9NQX3 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC24.85■■□□□ 1.57
GPHNQ9NQX3 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
GPHNQ9NQX3 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
GPHNQ9NQX3 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
GPHNQ9NQX3 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
GPHNQ9NQX3 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
GPHNQ9NQX3 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
GPHNQ9NQX3 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GPHNQ9NQX3 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
GPHNQ9NQX3 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GPHNQ9NQX3 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GPHNQ9NQX3 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GPHNQ9NQX3 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GPHNQ9NQX3 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
GPHNQ9NQX3 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
GPHNQ9NQX3 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GPHNQ9NQX3 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GPHNQ9NQX3 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GPHNQ9NQX3 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
GPHNQ9NQX3 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
GPHNQ9NQX3 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GPHNQ9NQX3 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
GPHNQ9NQX3 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
GPHNQ9NQX3 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
GPHNQ9NQX3 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GPHNQ9NQX3 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
GPHNQ9NQX3 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC24.83■■□□□ 1.57
GPHNQ9NQX3 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
GPHNQ9NQX3 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
GPHNQ9NQX3 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
GPHNQ9NQX3 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
GPHNQ9NQX3 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GPHNQ9NQX3 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
GPHNQ9NQX3 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GPHNQ9NQX3 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC24.83■■□□□ 1.56
GPHNQ9NQX3 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GPHNQ9NQX3 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GPHNQ9NQX3 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
GPHNQ9NQX3 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
GPHNQ9NQX3 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
GPHNQ9NQX3 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
GPHNQ9NQX3 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
GPHNQ9NQX3 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GPHNQ9NQX3 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GPHNQ9NQX3 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GPHNQ9NQX3 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
GPHNQ9NQX3 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GPHNQ9NQX3 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GPHNQ9NQX3 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GPHNQ9NQX3 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GPHNQ9NQX3 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GPHNQ9NQX3 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GPHNQ9NQX3 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
GPHNQ9NQX3 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GPHNQ9NQX3 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
GPHNQ9NQX3 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms