Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQC7

CYLD, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase CYLD, humanhuman

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Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYLDQ9NQC7 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CYLDQ9NQC7 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CYLDQ9NQC7 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CYLDQ9NQC7 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CYLDQ9NQC7 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CYLDQ9NQC7 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CYLDQ9NQC7 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CYLDQ9NQC7 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CYLDQ9NQC7 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CYLDQ9NQC7 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CYLDQ9NQC7 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CYLDQ9NQC7 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CYLDQ9NQC7 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CYLDQ9NQC7 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CYLDQ9NQC7 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CYLDQ9NQC7 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CYLDQ9NQC7 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CYLDQ9NQC7 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CYLDQ9NQC7 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CYLDQ9NQC7 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CYLDQ9NQC7 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CYLDQ9NQC7 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CYLDQ9NQC7 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CYLDQ9NQC7 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CYLDQ9NQC7 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CYLDQ9NQC7 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CYLDQ9NQC7 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CYLDQ9NQC7 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CYLDQ9NQC7 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CYLDQ9NQC7 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CYLDQ9NQC7 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CYLDQ9NQC7 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CYLDQ9NQC7 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CYLDQ9NQC7 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CYLDQ9NQC7 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CYLDQ9NQC7 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CYLDQ9NQC7 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CYLDQ9NQC7 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CYLDQ9NQC7 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CYLDQ9NQC7 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CYLDQ9NQC7 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CYLDQ9NQC7 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CYLDQ9NQC7 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CYLDQ9NQC7 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CYLDQ9NQC7 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CYLDQ9NQC7 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CYLDQ9NQC7 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CYLDQ9NQC7 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CYLDQ9NQC7 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CYLDQ9NQC7 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CYLDQ9NQC7 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CYLDQ9NQC7 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CYLDQ9NQC7 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CYLDQ9NQC7 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CYLDQ9NQC7 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CYLDQ9NQC7 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CYLDQ9NQC7 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CYLDQ9NQC7 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CYLDQ9NQC7 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CYLDQ9NQC7 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CYLDQ9NQC7 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CYLDQ9NQC7 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CYLDQ9NQC7 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CYLDQ9NQC7 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CYLDQ9NQC7 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CYLDQ9NQC7 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CYLDQ9NQC7 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CYLDQ9NQC7 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CYLDQ9NQC7 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CYLDQ9NQC7 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CYLDQ9NQC7 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CYLDQ9NQC7 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CYLDQ9NQC7 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CYLDQ9NQC7 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CYLDQ9NQC7 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CYLDQ9NQC7 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CYLDQ9NQC7 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CYLDQ9NQC7 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CYLDQ9NQC7 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CYLDQ9NQC7 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CYLDQ9NQC7 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CYLDQ9NQC7 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CYLDQ9NQC7 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CYLDQ9NQC7 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CYLDQ9NQC7 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CYLDQ9NQC7 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CYLDQ9NQC7 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CYLDQ9NQC7 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CYLDQ9NQC7 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CYLDQ9NQC7 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CYLDQ9NQC7 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CYLDQ9NQC7 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CYLDQ9NQC7 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CYLDQ9NQC7 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CYLDQ9NQC7 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CYLDQ9NQC7 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CYLDQ9NQC7 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CYLDQ9NQC7 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CYLDQ9NQC7 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CYLDQ9NQC7 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
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