Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ33

ASCL3, Achaete-scute homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASCL3Q9NQ33 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
ASCL3Q9NQ33 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ASCL3Q9NQ33 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ASCL3Q9NQ33 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ASCL3Q9NQ33 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ASCL3Q9NQ33 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ASCL3Q9NQ33 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ASCL3Q9NQ33 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ASCL3Q9NQ33 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ASCL3Q9NQ33 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ASCL3Q9NQ33 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ASCL3Q9NQ33 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ASCL3Q9NQ33 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ASCL3Q9NQ33 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ASCL3Q9NQ33 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ASCL3Q9NQ33 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ASCL3Q9NQ33 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ASCL3Q9NQ33 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ASCL3Q9NQ33 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ASCL3Q9NQ33 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
ASCL3Q9NQ33 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ASCL3Q9NQ33 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ASCL3Q9NQ33 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ASCL3Q9NQ33 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ASCL3Q9NQ33 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ASCL3Q9NQ33 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ASCL3Q9NQ33 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ASCL3Q9NQ33 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ASCL3Q9NQ33 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ASCL3Q9NQ33 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ASCL3Q9NQ33 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ASCL3Q9NQ33 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ASCL3Q9NQ33 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
ASCL3Q9NQ33 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ASCL3Q9NQ33 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ASCL3Q9NQ33 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ASCL3Q9NQ33 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ASCL3Q9NQ33 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ASCL3Q9NQ33 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ASCL3Q9NQ33 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ASCL3Q9NQ33 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ASCL3Q9NQ33 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ASCL3Q9NQ33 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ASCL3Q9NQ33 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ASCL3Q9NQ33 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
ASCL3Q9NQ33 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ASCL3Q9NQ33 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ASCL3Q9NQ33 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ASCL3Q9NQ33 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
ASCL3Q9NQ33 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ASCL3Q9NQ33 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ASCL3Q9NQ33 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ASCL3Q9NQ33 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ASCL3Q9NQ33 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ASCL3Q9NQ33 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ASCL3Q9NQ33 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ASCL3Q9NQ33 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ASCL3Q9NQ33 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ASCL3Q9NQ33 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ASCL3Q9NQ33 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ASCL3Q9NQ33 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ASCL3Q9NQ33 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ASCL3Q9NQ33 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ASCL3Q9NQ33 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ASCL3Q9NQ33 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ASCL3Q9NQ33 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ASCL3Q9NQ33 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ASCL3Q9NQ33 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
ASCL3Q9NQ33 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ASCL3Q9NQ33 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ASCL3Q9NQ33 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ASCL3Q9NQ33 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ASCL3Q9NQ33 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ASCL3Q9NQ33 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ASCL3Q9NQ33 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ASCL3Q9NQ33 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
ASCL3Q9NQ33 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ASCL3Q9NQ33 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ASCL3Q9NQ33 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ASCL3Q9NQ33 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ASCL3Q9NQ33 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ASCL3Q9NQ33 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ASCL3Q9NQ33 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ASCL3Q9NQ33 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ASCL3Q9NQ33 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ASCL3Q9NQ33 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ASCL3Q9NQ33 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ASCL3Q9NQ33 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ASCL3Q9NQ33 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ASCL3Q9NQ33 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ASCL3Q9NQ33 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ASCL3Q9NQ33 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
ASCL3Q9NQ33 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ASCL3Q9NQ33 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ASCL3Q9NQ33 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ASCL3Q9NQ33 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
ASCL3Q9NQ33 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
ASCL3Q9NQ33 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ASCL3Q9NQ33 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ASCL3Q9NQ33 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms