Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPL8

TIMMDC1, Complex I assembly factor TIMMDC1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMMDC1Q9NPL8 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
TIMMDC1Q9NPL8 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TIMMDC1Q9NPL8 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TIMMDC1Q9NPL8 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TIMMDC1Q9NPL8 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TIMMDC1Q9NPL8 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TIMMDC1Q9NPL8 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TIMMDC1Q9NPL8 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
TIMMDC1Q9NPL8 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TIMMDC1Q9NPL8 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TIMMDC1Q9NPL8 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TIMMDC1Q9NPL8 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TIMMDC1Q9NPL8 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TIMMDC1Q9NPL8 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TIMMDC1Q9NPL8 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
TIMMDC1Q9NPL8 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TIMMDC1Q9NPL8 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TIMMDC1Q9NPL8 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TIMMDC1Q9NPL8 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TIMMDC1Q9NPL8 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TIMMDC1Q9NPL8 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TIMMDC1Q9NPL8 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TIMMDC1Q9NPL8 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TIMMDC1Q9NPL8 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TIMMDC1Q9NPL8 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TIMMDC1Q9NPL8 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TIMMDC1Q9NPL8 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TIMMDC1Q9NPL8 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TIMMDC1Q9NPL8 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TIMMDC1Q9NPL8 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TIMMDC1Q9NPL8 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TIMMDC1Q9NPL8 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TIMMDC1Q9NPL8 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
TIMMDC1Q9NPL8 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TIMMDC1Q9NPL8 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TIMMDC1Q9NPL8 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TIMMDC1Q9NPL8 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TIMMDC1Q9NPL8 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TIMMDC1Q9NPL8 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TIMMDC1Q9NPL8 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TIMMDC1Q9NPL8 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TIMMDC1Q9NPL8 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TIMMDC1Q9NPL8 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TIMMDC1Q9NPL8 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TIMMDC1Q9NPL8 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
TIMMDC1Q9NPL8 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TIMMDC1Q9NPL8 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
TIMMDC1Q9NPL8 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
TIMMDC1Q9NPL8 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TIMMDC1Q9NPL8 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TIMMDC1Q9NPL8 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TIMMDC1Q9NPL8 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TIMMDC1Q9NPL8 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TIMMDC1Q9NPL8 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TIMMDC1Q9NPL8 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TIMMDC1Q9NPL8 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TIMMDC1Q9NPL8 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TIMMDC1Q9NPL8 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TIMMDC1Q9NPL8 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TIMMDC1Q9NPL8 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TIMMDC1Q9NPL8 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TIMMDC1Q9NPL8 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TIMMDC1Q9NPL8 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TIMMDC1Q9NPL8 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TIMMDC1Q9NPL8 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TIMMDC1Q9NPL8 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TIMMDC1Q9NPL8 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TIMMDC1Q9NPL8 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TIMMDC1Q9NPL8 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TIMMDC1Q9NPL8 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TIMMDC1Q9NPL8 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TIMMDC1Q9NPL8 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TIMMDC1Q9NPL8 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TIMMDC1Q9NPL8 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TIMMDC1Q9NPL8 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TIMMDC1Q9NPL8 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TIMMDC1Q9NPL8 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TIMMDC1Q9NPL8 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TIMMDC1Q9NPL8 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TIMMDC1Q9NPL8 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TIMMDC1Q9NPL8 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TIMMDC1Q9NPL8 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TIMMDC1Q9NPL8 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TIMMDC1Q9NPL8 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TIMMDC1Q9NPL8 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TIMMDC1Q9NPL8 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
TIMMDC1Q9NPL8 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TIMMDC1Q9NPL8 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TIMMDC1Q9NPL8 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TIMMDC1Q9NPL8 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TIMMDC1Q9NPL8 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TIMMDC1Q9NPL8 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TIMMDC1Q9NPL8 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TIMMDC1Q9NPL8 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TIMMDC1Q9NPL8 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
TIMMDC1Q9NPL8 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
TIMMDC1Q9NPL8 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TIMMDC1Q9NPL8 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TIMMDC1Q9NPL8 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
TIMMDC1Q9NPL8 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms