Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPG4

PCDH12, Protocadherin-12, humanhuman

Predictions only

Length 1,184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDH12Q9NPG4 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PCDH12Q9NPG4 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PCDH12Q9NPG4 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PCDH12Q9NPG4 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PCDH12Q9NPG4 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PCDH12Q9NPG4 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PCDH12Q9NPG4 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PCDH12Q9NPG4 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PCDH12Q9NPG4 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PCDH12Q9NPG4 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PCDH12Q9NPG4 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
PCDH12Q9NPG4 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PCDH12Q9NPG4 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PCDH12Q9NPG4 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PCDH12Q9NPG4 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PCDH12Q9NPG4 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PCDH12Q9NPG4 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PCDH12Q9NPG4 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PCDH12Q9NPG4 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PCDH12Q9NPG4 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PCDH12Q9NPG4 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PCDH12Q9NPG4 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PCDH12Q9NPG4 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PCDH12Q9NPG4 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PCDH12Q9NPG4 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PCDH12Q9NPG4 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PCDH12Q9NPG4 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PCDH12Q9NPG4 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PCDH12Q9NPG4 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PCDH12Q9NPG4 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PCDH12Q9NPG4 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
PCDH12Q9NPG4 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PCDH12Q9NPG4 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PCDH12Q9NPG4 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PCDH12Q9NPG4 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PCDH12Q9NPG4 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PCDH12Q9NPG4 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PCDH12Q9NPG4 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PCDH12Q9NPG4 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PCDH12Q9NPG4 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PCDH12Q9NPG4 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PCDH12Q9NPG4 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PCDH12Q9NPG4 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PCDH12Q9NPG4 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PCDH12Q9NPG4 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PCDH12Q9NPG4 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
PCDH12Q9NPG4 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PCDH12Q9NPG4 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PCDH12Q9NPG4 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PCDH12Q9NPG4 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PCDH12Q9NPG4 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.99
PCDH12Q9NPG4 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PCDH12Q9NPG4 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PCDH12Q9NPG4 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PCDH12Q9NPG4 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PCDH12Q9NPG4 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PCDH12Q9NPG4 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PCDH12Q9NPG4 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PCDH12Q9NPG4 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PCDH12Q9NPG4 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PCDH12Q9NPG4 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
PCDH12Q9NPG4 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
PCDH12Q9NPG4 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PCDH12Q9NPG4 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
PCDH12Q9NPG4 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PCDH12Q9NPG4 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
PCDH12Q9NPG4 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PCDH12Q9NPG4 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PCDH12Q9NPG4 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PCDH12Q9NPG4 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PCDH12Q9NPG4 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PCDH12Q9NPG4 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PCDH12Q9NPG4 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PCDH12Q9NPG4 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PCDH12Q9NPG4 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PCDH12Q9NPG4 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PCDH12Q9NPG4 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PCDH12Q9NPG4 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PCDH12Q9NPG4 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PCDH12Q9NPG4 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PCDH12Q9NPG4 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PCDH12Q9NPG4 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PCDH12Q9NPG4 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PCDH12Q9NPG4 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PCDH12Q9NPG4 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PCDH12Q9NPG4 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PCDH12Q9NPG4 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PCDH12Q9NPG4 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PCDH12Q9NPG4 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PCDH12Q9NPG4 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PCDH12Q9NPG4 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PCDH12Q9NPG4 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PCDH12Q9NPG4 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
PCDH12Q9NPG4 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PCDH12Q9NPG4 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PCDH12Q9NPG4 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PCDH12Q9NPG4 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PCDH12Q9NPG4 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PCDH12Q9NPG4 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PCDH12Q9NPG4 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms