Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7U1

CCSER2, Serine-rich coiled-coil domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 834 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSER2Q9H7U1 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCSER2Q9H7U1 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCSER2Q9H7U1 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCSER2Q9H7U1 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CCSER2Q9H7U1 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCSER2Q9H7U1 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCSER2Q9H7U1 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCSER2Q9H7U1 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCSER2Q9H7U1 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCSER2Q9H7U1 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCSER2Q9H7U1 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCSER2Q9H7U1 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCSER2Q9H7U1 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCSER2Q9H7U1 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCSER2Q9H7U1 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCSER2Q9H7U1 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCSER2Q9H7U1 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCSER2Q9H7U1 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCSER2Q9H7U1 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCSER2Q9H7U1 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCSER2Q9H7U1 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCSER2Q9H7U1 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCSER2Q9H7U1 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
CCSER2Q9H7U1 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCSER2Q9H7U1 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCSER2Q9H7U1 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCSER2Q9H7U1 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCSER2Q9H7U1 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCSER2Q9H7U1 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCSER2Q9H7U1 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
CCSER2Q9H7U1 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCSER2Q9H7U1 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCSER2Q9H7U1 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCSER2Q9H7U1 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
CCSER2Q9H7U1 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCSER2Q9H7U1 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCSER2Q9H7U1 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCSER2Q9H7U1 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCSER2Q9H7U1 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCSER2Q9H7U1 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CCSER2Q9H7U1 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CCSER2Q9H7U1 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCSER2Q9H7U1 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCSER2Q9H7U1 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCSER2Q9H7U1 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCSER2Q9H7U1 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCSER2Q9H7U1 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCSER2Q9H7U1 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCSER2Q9H7U1 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCSER2Q9H7U1 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCSER2Q9H7U1 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCSER2Q9H7U1 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCSER2Q9H7U1 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCSER2Q9H7U1 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCSER2Q9H7U1 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCSER2Q9H7U1 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCSER2Q9H7U1 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCSER2Q9H7U1 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCSER2Q9H7U1 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCSER2Q9H7U1 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
CCSER2Q9H7U1 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCSER2Q9H7U1 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCSER2Q9H7U1 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCSER2Q9H7U1 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCSER2Q9H7U1 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCSER2Q9H7U1 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCSER2Q9H7U1 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCSER2Q9H7U1 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCSER2Q9H7U1 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCSER2Q9H7U1 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCSER2Q9H7U1 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCSER2Q9H7U1 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCSER2Q9H7U1 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCSER2Q9H7U1 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCSER2Q9H7U1 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCSER2Q9H7U1 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
CCSER2Q9H7U1 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCSER2Q9H7U1 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCSER2Q9H7U1 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCSER2Q9H7U1 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
CCSER2Q9H7U1 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCSER2Q9H7U1 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCSER2Q9H7U1 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCSER2Q9H7U1 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCSER2Q9H7U1 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCSER2Q9H7U1 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCSER2Q9H7U1 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCSER2Q9H7U1 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCSER2Q9H7U1 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCSER2Q9H7U1 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
CCSER2Q9H7U1 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCSER2Q9H7U1 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCSER2Q9H7U1 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCSER2Q9H7U1 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCSER2Q9H7U1 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCSER2Q9H7U1 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCSER2Q9H7U1 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCSER2Q9H7U1 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCSER2Q9H7U1 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCSER2Q9H7U1 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms