Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6T3

RPAP3, RNA polymerase II-associated protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPAP3Q9H6T3 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
RPAP3Q9H6T3 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RPAP3Q9H6T3 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RPAP3Q9H6T3 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RPAP3Q9H6T3 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RPAP3Q9H6T3 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RPAP3Q9H6T3 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RPAP3Q9H6T3 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RPAP3Q9H6T3 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
RPAP3Q9H6T3 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RPAP3Q9H6T3 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RPAP3Q9H6T3 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
RPAP3Q9H6T3 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
RPAP3Q9H6T3 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
RPAP3Q9H6T3 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
RPAP3Q9H6T3 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
RPAP3Q9H6T3 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RPAP3Q9H6T3 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RPAP3Q9H6T3 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RPAP3Q9H6T3 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RPAP3Q9H6T3 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RPAP3Q9H6T3 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RPAP3Q9H6T3 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
RPAP3Q9H6T3 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RPAP3Q9H6T3 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RPAP3Q9H6T3 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RPAP3Q9H6T3 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RPAP3Q9H6T3 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RPAP3Q9H6T3 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RPAP3Q9H6T3 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RPAP3Q9H6T3 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RPAP3Q9H6T3 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RPAP3Q9H6T3 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RPAP3Q9H6T3 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RPAP3Q9H6T3 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RPAP3Q9H6T3 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RPAP3Q9H6T3 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RPAP3Q9H6T3 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
RPAP3Q9H6T3 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RPAP3Q9H6T3 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RPAP3Q9H6T3 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RPAP3Q9H6T3 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RPAP3Q9H6T3 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RPAP3Q9H6T3 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RPAP3Q9H6T3 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RPAP3Q9H6T3 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RPAP3Q9H6T3 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RPAP3Q9H6T3 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RPAP3Q9H6T3 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RPAP3Q9H6T3 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RPAP3Q9H6T3 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RPAP3Q9H6T3 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
RPAP3Q9H6T3 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RPAP3Q9H6T3 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RPAP3Q9H6T3 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RPAP3Q9H6T3 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RPAP3Q9H6T3 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RPAP3Q9H6T3 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RPAP3Q9H6T3 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
RPAP3Q9H6T3 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RPAP3Q9H6T3 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
RPAP3Q9H6T3 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RPAP3Q9H6T3 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RPAP3Q9H6T3 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RPAP3Q9H6T3 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RPAP3Q9H6T3 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RPAP3Q9H6T3 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RPAP3Q9H6T3 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RPAP3Q9H6T3 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RPAP3Q9H6T3 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RPAP3Q9H6T3 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RPAP3Q9H6T3 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
RPAP3Q9H6T3 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RPAP3Q9H6T3 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RPAP3Q9H6T3 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RPAP3Q9H6T3 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RPAP3Q9H6T3 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RPAP3Q9H6T3 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RPAP3Q9H6T3 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RPAP3Q9H6T3 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RPAP3Q9H6T3 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RPAP3Q9H6T3 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RPAP3Q9H6T3 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
RPAP3Q9H6T3 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RPAP3Q9H6T3 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RPAP3Q9H6T3 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
RPAP3Q9H6T3 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RPAP3Q9H6T3 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RPAP3Q9H6T3 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RPAP3Q9H6T3 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RPAP3Q9H6T3 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RPAP3Q9H6T3 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RPAP3Q9H6T3 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RPAP3Q9H6T3 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RPAP3Q9H6T3 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RPAP3Q9H6T3 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RPAP3Q9H6T3 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RPAP3Q9H6T3 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RPAP3Q9H6T3 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RPAP3Q9H6T3 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms