Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6J7

C11orf49, UPF0705 protein C11orf49, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C11orf49Q9H6J7 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
C11orf49Q9H6J7 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
C11orf49Q9H6J7 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
C11orf49Q9H6J7 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
C11orf49Q9H6J7 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
C11orf49Q9H6J7 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
C11orf49Q9H6J7 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
C11orf49Q9H6J7 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
C11orf49Q9H6J7 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
C11orf49Q9H6J7 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
C11orf49Q9H6J7 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
C11orf49Q9H6J7 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
C11orf49Q9H6J7 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
C11orf49Q9H6J7 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
C11orf49Q9H6J7 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
C11orf49Q9H6J7 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
C11orf49Q9H6J7 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
C11orf49Q9H6J7 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
C11orf49Q9H6J7 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
C11orf49Q9H6J7 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
C11orf49Q9H6J7 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
C11orf49Q9H6J7 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
C11orf49Q9H6J7 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
C11orf49Q9H6J7 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
C11orf49Q9H6J7 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
C11orf49Q9H6J7 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
C11orf49Q9H6J7 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
C11orf49Q9H6J7 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
C11orf49Q9H6J7 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
C11orf49Q9H6J7 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
C11orf49Q9H6J7 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
C11orf49Q9H6J7 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
C11orf49Q9H6J7 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
C11orf49Q9H6J7 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
C11orf49Q9H6J7 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
C11orf49Q9H6J7 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
C11orf49Q9H6J7 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
C11orf49Q9H6J7 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
C11orf49Q9H6J7 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
C11orf49Q9H6J7 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
C11orf49Q9H6J7 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
C11orf49Q9H6J7 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
C11orf49Q9H6J7 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
C11orf49Q9H6J7 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
C11orf49Q9H6J7 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
C11orf49Q9H6J7 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
C11orf49Q9H6J7 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
C11orf49Q9H6J7 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
C11orf49Q9H6J7 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
C11orf49Q9H6J7 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
C11orf49Q9H6J7 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
C11orf49Q9H6J7 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
C11orf49Q9H6J7 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
C11orf49Q9H6J7 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
C11orf49Q9H6J7 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
C11orf49Q9H6J7 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
C11orf49Q9H6J7 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
C11orf49Q9H6J7 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
C11orf49Q9H6J7 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
C11orf49Q9H6J7 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
C11orf49Q9H6J7 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
C11orf49Q9H6J7 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
C11orf49Q9H6J7 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
C11orf49Q9H6J7 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
C11orf49Q9H6J7 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
C11orf49Q9H6J7 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
C11orf49Q9H6J7 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
C11orf49Q9H6J7 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
C11orf49Q9H6J7 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
C11orf49Q9H6J7 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
C11orf49Q9H6J7 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
C11orf49Q9H6J7 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
C11orf49Q9H6J7 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
C11orf49Q9H6J7 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
C11orf49Q9H6J7 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
C11orf49Q9H6J7 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
C11orf49Q9H6J7 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
C11orf49Q9H6J7 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
C11orf49Q9H6J7 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
C11orf49Q9H6J7 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
C11orf49Q9H6J7 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
C11orf49Q9H6J7 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
C11orf49Q9H6J7 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
C11orf49Q9H6J7 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
C11orf49Q9H6J7 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
C11orf49Q9H6J7 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
C11orf49Q9H6J7 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
C11orf49Q9H6J7 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
C11orf49Q9H6J7 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
C11orf49Q9H6J7 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
C11orf49Q9H6J7 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
C11orf49Q9H6J7 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
C11orf49Q9H6J7 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
C11orf49Q9H6J7 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
C11orf49Q9H6J7 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
C11orf49Q9H6J7 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
C11orf49Q9H6J7 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
C11orf49Q9H6J7 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
C11orf49Q9H6J7 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
C11orf49Q9H6J7 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms