Protein–RNA interactions for Protein: Q9H446

RWDD1, RWD domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RWDD1Q9H446 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
RWDD1Q9H446 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
RWDD1Q9H446 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
RWDD1Q9H446 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
RWDD1Q9H446 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
RWDD1Q9H446 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
RWDD1Q9H446 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
RWDD1Q9H446 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
RWDD1Q9H446 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
RWDD1Q9H446 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
RWDD1Q9H446 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
RWDD1Q9H446 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
RWDD1Q9H446 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
RWDD1Q9H446 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
RWDD1Q9H446 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
RWDD1Q9H446 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
RWDD1Q9H446 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
RWDD1Q9H446 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
RWDD1Q9H446 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
RWDD1Q9H446 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
RWDD1Q9H446 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
RWDD1Q9H446 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
RWDD1Q9H446 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
RWDD1Q9H446 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
RWDD1Q9H446 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
RWDD1Q9H446 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
RWDD1Q9H446 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
RWDD1Q9H446 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
RWDD1Q9H446 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
RWDD1Q9H446 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
RWDD1Q9H446 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
RWDD1Q9H446 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
RWDD1Q9H446 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
RWDD1Q9H446 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
RWDD1Q9H446 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
RWDD1Q9H446 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
RWDD1Q9H446 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
RWDD1Q9H446 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
RWDD1Q9H446 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
RWDD1Q9H446 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
RWDD1Q9H446 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
RWDD1Q9H446 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
RWDD1Q9H446 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
RWDD1Q9H446 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
RWDD1Q9H446 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
RWDD1Q9H446 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
RWDD1Q9H446 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
RWDD1Q9H446 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
RWDD1Q9H446 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC26.39■■□□□ 1.82
RWDD1Q9H446 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
RWDD1Q9H446 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
RWDD1Q9H446 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
RWDD1Q9H446 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
RWDD1Q9H446 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
RWDD1Q9H446 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
RWDD1Q9H446 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
RWDD1Q9H446 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
RWDD1Q9H446 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
RWDD1Q9H446 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
RWDD1Q9H446 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
RWDD1Q9H446 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
RWDD1Q9H446 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.38■■□□□ 1.81
RWDD1Q9H446 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
RWDD1Q9H446 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
RWDD1Q9H446 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
RWDD1Q9H446 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
RWDD1Q9H446 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
RWDD1Q9H446 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
RWDD1Q9H446 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
RWDD1Q9H446 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
RWDD1Q9H446 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.38■■□□□ 1.81
RWDD1Q9H446 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
RWDD1Q9H446 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
RWDD1Q9H446 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
RWDD1Q9H446 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
RWDD1Q9H446 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
RWDD1Q9H446 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
RWDD1Q9H446 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
RWDD1Q9H446 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
RWDD1Q9H446 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
RWDD1Q9H446 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
RWDD1Q9H446 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
RWDD1Q9H446 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
RWDD1Q9H446 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
RWDD1Q9H446 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
RWDD1Q9H446 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
RWDD1Q9H446 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
RWDD1Q9H446 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
RWDD1Q9H446 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
RWDD1Q9H446 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
RWDD1Q9H446 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
RWDD1Q9H446 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
RWDD1Q9H446 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
RWDD1Q9H446 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
RWDD1Q9H446 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
RWDD1Q9H446 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
RWDD1Q9H446 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
RWDD1Q9H446 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
RWDD1Q9H446 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
RWDD1Q9H446 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms