Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZU5

NYX, Nyctalopin, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NYXQ9GZU5 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
NYXQ9GZU5 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NYXQ9GZU5 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NYXQ9GZU5 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC26.34■■□□□ 1.81
NYXQ9GZU5 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
NYXQ9GZU5 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
NYXQ9GZU5 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
NYXQ9GZU5 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
NYXQ9GZU5 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
NYXQ9GZU5 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
NYXQ9GZU5 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NYXQ9GZU5 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
NYXQ9GZU5 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
NYXQ9GZU5 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
NYXQ9GZU5 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
NYXQ9GZU5 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
NYXQ9GZU5 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
NYXQ9GZU5 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
NYXQ9GZU5 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
NYXQ9GZU5 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
NYXQ9GZU5 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.8
NYXQ9GZU5 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
NYXQ9GZU5 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
NYXQ9GZU5 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
NYXQ9GZU5 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
NYXQ9GZU5 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
NYXQ9GZU5 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
NYXQ9GZU5 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
NYXQ9GZU5 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
NYXQ9GZU5 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
NYXQ9GZU5 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
NYXQ9GZU5 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
NYXQ9GZU5 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
NYXQ9GZU5 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
NYXQ9GZU5 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
NYXQ9GZU5 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
NYXQ9GZU5 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
NYXQ9GZU5 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
NYXQ9GZU5 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
NYXQ9GZU5 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
NYXQ9GZU5 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
NYXQ9GZU5 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
NYXQ9GZU5 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
NYXQ9GZU5 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
NYXQ9GZU5 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
NYXQ9GZU5 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
NYXQ9GZU5 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
NYXQ9GZU5 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
NYXQ9GZU5 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
NYXQ9GZU5 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
NYXQ9GZU5 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
NYXQ9GZU5 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
NYXQ9GZU5 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
NYXQ9GZU5 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
NYXQ9GZU5 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
NYXQ9GZU5 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC26.31■■□□□ 1.8
NYXQ9GZU5 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
NYXQ9GZU5 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
NYXQ9GZU5 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
NYXQ9GZU5 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
NYXQ9GZU5 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
NYXQ9GZU5 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
NYXQ9GZU5 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
NYXQ9GZU5 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
NYXQ9GZU5 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
NYXQ9GZU5 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
NYXQ9GZU5 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
NYXQ9GZU5 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
NYXQ9GZU5 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
NYXQ9GZU5 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
NYXQ9GZU5 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
NYXQ9GZU5 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
NYXQ9GZU5 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
NYXQ9GZU5 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
NYXQ9GZU5 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
NYXQ9GZU5 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
NYXQ9GZU5 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
NYXQ9GZU5 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
NYXQ9GZU5 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
NYXQ9GZU5 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
NYXQ9GZU5 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
NYXQ9GZU5 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
NYXQ9GZU5 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
NYXQ9GZU5 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
NYXQ9GZU5 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC26.29■■□□□ 1.8
NYXQ9GZU5 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
NYXQ9GZU5 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
NYXQ9GZU5 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
NYXQ9GZU5 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
NYXQ9GZU5 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
NYXQ9GZU5 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
NYXQ9GZU5 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
NYXQ9GZU5 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
NYXQ9GZU5 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
NYXQ9GZU5 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
NYXQ9GZU5 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
NYXQ9GZU5 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
NYXQ9GZU5 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
NYXQ9GZU5 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
NYXQ9GZU5 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms