Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYS8

LRRC2, Leucine-rich repeat-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 371 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC2Q9BYS8 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
LRRC2Q9BYS8 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LRRC2Q9BYS8 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LRRC2Q9BYS8 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LRRC2Q9BYS8 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LRRC2Q9BYS8 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
LRRC2Q9BYS8 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LRRC2Q9BYS8 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LRRC2Q9BYS8 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LRRC2Q9BYS8 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LRRC2Q9BYS8 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LRRC2Q9BYS8 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LRRC2Q9BYS8 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
LRRC2Q9BYS8 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LRRC2Q9BYS8 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LRRC2Q9BYS8 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
LRRC2Q9BYS8 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LRRC2Q9BYS8 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
LRRC2Q9BYS8 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
LRRC2Q9BYS8 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
LRRC2Q9BYS8 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
LRRC2Q9BYS8 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
LRRC2Q9BYS8 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
LRRC2Q9BYS8 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
LRRC2Q9BYS8 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
LRRC2Q9BYS8 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
LRRC2Q9BYS8 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
LRRC2Q9BYS8 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
LRRC2Q9BYS8 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
LRRC2Q9BYS8 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
LRRC2Q9BYS8 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LRRC2Q9BYS8 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LRRC2Q9BYS8 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
LRRC2Q9BYS8 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
LRRC2Q9BYS8 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LRRC2Q9BYS8 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC24.88■■□□□ 1.57
LRRC2Q9BYS8 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
LRRC2Q9BYS8 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LRRC2Q9BYS8 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LRRC2Q9BYS8 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
LRRC2Q9BYS8 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LRRC2Q9BYS8 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
LRRC2Q9BYS8 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
LRRC2Q9BYS8 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
LRRC2Q9BYS8 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
LRRC2Q9BYS8 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
LRRC2Q9BYS8 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
LRRC2Q9BYS8 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
LRRC2Q9BYS8 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
LRRC2Q9BYS8 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
LRRC2Q9BYS8 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LRRC2Q9BYS8 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LRRC2Q9BYS8 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LRRC2Q9BYS8 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
LRRC2Q9BYS8 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LRRC2Q9BYS8 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
LRRC2Q9BYS8 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LRRC2Q9BYS8 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
LRRC2Q9BYS8 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
LRRC2Q9BYS8 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
LRRC2Q9BYS8 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
LRRC2Q9BYS8 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LRRC2Q9BYS8 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LRRC2Q9BYS8 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
LRRC2Q9BYS8 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LRRC2Q9BYS8 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
LRRC2Q9BYS8 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
LRRC2Q9BYS8 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LRRC2Q9BYS8 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LRRC2Q9BYS8 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LRRC2Q9BYS8 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LRRC2Q9BYS8 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LRRC2Q9BYS8 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LRRC2Q9BYS8 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LRRC2Q9BYS8 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
LRRC2Q9BYS8 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
LRRC2Q9BYS8 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
LRRC2Q9BYS8 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
LRRC2Q9BYS8 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LRRC2Q9BYS8 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
LRRC2Q9BYS8 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
LRRC2Q9BYS8 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LRRC2Q9BYS8 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
LRRC2Q9BYS8 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
LRRC2Q9BYS8 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LRRC2Q9BYS8 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LRRC2Q9BYS8 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
LRRC2Q9BYS8 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
LRRC2Q9BYS8 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LRRC2Q9BYS8 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
LRRC2Q9BYS8 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
LRRC2Q9BYS8 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LRRC2Q9BYS8 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LRRC2Q9BYS8 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
LRRC2Q9BYS8 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LRRC2Q9BYS8 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LRRC2Q9BYS8 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LRRC2Q9BYS8 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LRRC2Q9BYS8 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LRRC2Q9BYS8 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms