Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY43

CHMP4A, Charged multivesicular body protein 4a, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP4AQ9BY43 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CHMP4AQ9BY43 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CHMP4AQ9BY43 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CHMP4AQ9BY43 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CHMP4AQ9BY43 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CHMP4AQ9BY43 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CHMP4AQ9BY43 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CHMP4AQ9BY43 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CHMP4AQ9BY43 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CHMP4AQ9BY43 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CHMP4AQ9BY43 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CHMP4AQ9BY43 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CHMP4AQ9BY43 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CHMP4AQ9BY43 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CHMP4AQ9BY43 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CHMP4AQ9BY43 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CHMP4AQ9BY43 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CHMP4AQ9BY43 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CHMP4AQ9BY43 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CHMP4AQ9BY43 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CHMP4AQ9BY43 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CHMP4AQ9BY43 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CHMP4AQ9BY43 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CHMP4AQ9BY43 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CHMP4AQ9BY43 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CHMP4AQ9BY43 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CHMP4AQ9BY43 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CHMP4AQ9BY43 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
CHMP4AQ9BY43 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CHMP4AQ9BY43 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CHMP4AQ9BY43 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CHMP4AQ9BY43 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CHMP4AQ9BY43 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
CHMP4AQ9BY43 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CHMP4AQ9BY43 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CHMP4AQ9BY43 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CHMP4AQ9BY43 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CHMP4AQ9BY43 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CHMP4AQ9BY43 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CHMP4AQ9BY43 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CHMP4AQ9BY43 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CHMP4AQ9BY43 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CHMP4AQ9BY43 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CHMP4AQ9BY43 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CHMP4AQ9BY43 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CHMP4AQ9BY43 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CHMP4AQ9BY43 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CHMP4AQ9BY43 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CHMP4AQ9BY43 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CHMP4AQ9BY43 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CHMP4AQ9BY43 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CHMP4AQ9BY43 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CHMP4AQ9BY43 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CHMP4AQ9BY43 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CHMP4AQ9BY43 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CHMP4AQ9BY43 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CHMP4AQ9BY43 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CHMP4AQ9BY43 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CHMP4AQ9BY43 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CHMP4AQ9BY43 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CHMP4AQ9BY43 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CHMP4AQ9BY43 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CHMP4AQ9BY43 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CHMP4AQ9BY43 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CHMP4AQ9BY43 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CHMP4AQ9BY43 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CHMP4AQ9BY43 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CHMP4AQ9BY43 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CHMP4AQ9BY43 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CHMP4AQ9BY43 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CHMP4AQ9BY43 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CHMP4AQ9BY43 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CHMP4AQ9BY43 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CHMP4AQ9BY43 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CHMP4AQ9BY43 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CHMP4AQ9BY43 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CHMP4AQ9BY43 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CHMP4AQ9BY43 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CHMP4AQ9BY43 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CHMP4AQ9BY43 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CHMP4AQ9BY43 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
CHMP4AQ9BY43 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CHMP4AQ9BY43 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
CHMP4AQ9BY43 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
CHMP4AQ9BY43 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CHMP4AQ9BY43 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CHMP4AQ9BY43 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CHMP4AQ9BY43 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
CHMP4AQ9BY43 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
CHMP4AQ9BY43 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CHMP4AQ9BY43 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
CHMP4AQ9BY43 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CHMP4AQ9BY43 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CHMP4AQ9BY43 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CHMP4AQ9BY43 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CHMP4AQ9BY43 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CHMP4AQ9BY43 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CHMP4AQ9BY43 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CHMP4AQ9BY43 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CHMP4AQ9BY43 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms