Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTX1

NDC1, Nucleoporin NDC1, humanhuman

Predictions only

Length 674 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDC1Q9BTX1 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NDC1Q9BTX1 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NDC1Q9BTX1 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NDC1Q9BTX1 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NDC1Q9BTX1 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NDC1Q9BTX1 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NDC1Q9BTX1 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NDC1Q9BTX1 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NDC1Q9BTX1 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NDC1Q9BTX1 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NDC1Q9BTX1 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NDC1Q9BTX1 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NDC1Q9BTX1 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NDC1Q9BTX1 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NDC1Q9BTX1 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NDC1Q9BTX1 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NDC1Q9BTX1 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NDC1Q9BTX1 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
NDC1Q9BTX1 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NDC1Q9BTX1 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NDC1Q9BTX1 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NDC1Q9BTX1 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NDC1Q9BTX1 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NDC1Q9BTX1 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NDC1Q9BTX1 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NDC1Q9BTX1 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NDC1Q9BTX1 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NDC1Q9BTX1 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NDC1Q9BTX1 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NDC1Q9BTX1 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
NDC1Q9BTX1 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NDC1Q9BTX1 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NDC1Q9BTX1 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NDC1Q9BTX1 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NDC1Q9BTX1 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NDC1Q9BTX1 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NDC1Q9BTX1 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NDC1Q9BTX1 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NDC1Q9BTX1 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NDC1Q9BTX1 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NDC1Q9BTX1 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NDC1Q9BTX1 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NDC1Q9BTX1 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NDC1Q9BTX1 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NDC1Q9BTX1 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NDC1Q9BTX1 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
NDC1Q9BTX1 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NDC1Q9BTX1 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NDC1Q9BTX1 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NDC1Q9BTX1 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NDC1Q9BTX1 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NDC1Q9BTX1 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NDC1Q9BTX1 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NDC1Q9BTX1 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NDC1Q9BTX1 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NDC1Q9BTX1 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NDC1Q9BTX1 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NDC1Q9BTX1 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NDC1Q9BTX1 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NDC1Q9BTX1 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NDC1Q9BTX1 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NDC1Q9BTX1 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NDC1Q9BTX1 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NDC1Q9BTX1 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NDC1Q9BTX1 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NDC1Q9BTX1 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NDC1Q9BTX1 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NDC1Q9BTX1 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NDC1Q9BTX1 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
NDC1Q9BTX1 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NDC1Q9BTX1 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NDC1Q9BTX1 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NDC1Q9BTX1 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NDC1Q9BTX1 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NDC1Q9BTX1 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NDC1Q9BTX1 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NDC1Q9BTX1 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NDC1Q9BTX1 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NDC1Q9BTX1 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NDC1Q9BTX1 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
NDC1Q9BTX1 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NDC1Q9BTX1 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NDC1Q9BTX1 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
NDC1Q9BTX1 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NDC1Q9BTX1 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NDC1Q9BTX1 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NDC1Q9BTX1 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NDC1Q9BTX1 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NDC1Q9BTX1 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NDC1Q9BTX1 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NDC1Q9BTX1 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NDC1Q9BTX1 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NDC1Q9BTX1 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NDC1Q9BTX1 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NDC1Q9BTX1 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NDC1Q9BTX1 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NDC1Q9BTX1 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NDC1Q9BTX1 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NDC1Q9BTX1 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NDC1Q9BTX1 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms