Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTF0

THUMPD2, THUMP domain-containing protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THUMPD2Q9BTF0 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
THUMPD2Q9BTF0 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2
THUMPD2Q9BTF0 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
THUMPD2Q9BTF0 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
THUMPD2Q9BTF0 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
THUMPD2Q9BTF0 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
THUMPD2Q9BTF0 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
THUMPD2Q9BTF0 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC27.57■■■□□ 2
THUMPD2Q9BTF0 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC27.57■■■□□ 2
THUMPD2Q9BTF0 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
THUMPD2Q9BTF0 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC27.57■■■□□ 2
THUMPD2Q9BTF0 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
THUMPD2Q9BTF0 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC27.57■■■□□ 2
THUMPD2Q9BTF0 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
THUMPD2Q9BTF0 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
THUMPD2Q9BTF0 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
THUMPD2Q9BTF0 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
THUMPD2Q9BTF0 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
THUMPD2Q9BTF0 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
THUMPD2Q9BTF0 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC27.56■■■□□ 2
THUMPD2Q9BTF0 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
THUMPD2Q9BTF0 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
THUMPD2Q9BTF0 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
THUMPD2Q9BTF0 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
THUMPD2Q9BTF0 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
THUMPD2Q9BTF0 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
THUMPD2Q9BTF0 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
THUMPD2Q9BTF0 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.55■■■□□ 2
THUMPD2Q9BTF0 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
THUMPD2Q9BTF0 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
THUMPD2Q9BTF0 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
THUMPD2Q9BTF0 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
THUMPD2Q9BTF0 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
THUMPD2Q9BTF0 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
THUMPD2Q9BTF0 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
THUMPD2Q9BTF0 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
THUMPD2Q9BTF0 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
THUMPD2Q9BTF0 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
THUMPD2Q9BTF0 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
THUMPD2Q9BTF0 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
THUMPD2Q9BTF0 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
THUMPD2Q9BTF0 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
THUMPD2Q9BTF0 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
THUMPD2Q9BTF0 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
THUMPD2Q9BTF0 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
THUMPD2Q9BTF0 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
THUMPD2Q9BTF0 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
THUMPD2Q9BTF0 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
THUMPD2Q9BTF0 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
THUMPD2Q9BTF0 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
THUMPD2Q9BTF0 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
THUMPD2Q9BTF0 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
THUMPD2Q9BTF0 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
THUMPD2Q9BTF0 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
THUMPD2Q9BTF0 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
THUMPD2Q9BTF0 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
THUMPD2Q9BTF0 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
THUMPD2Q9BTF0 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC27.53■■■□□ 2
THUMPD2Q9BTF0 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC27.53■■■□□ 2
THUMPD2Q9BTF0 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
THUMPD2Q9BTF0 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
THUMPD2Q9BTF0 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
THUMPD2Q9BTF0 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
THUMPD2Q9BTF0 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
THUMPD2Q9BTF0 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
THUMPD2Q9BTF0 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
THUMPD2Q9BTF0 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
THUMPD2Q9BTF0 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
THUMPD2Q9BTF0 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
THUMPD2Q9BTF0 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
THUMPD2Q9BTF0 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
THUMPD2Q9BTF0 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
THUMPD2Q9BTF0 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC27.52■■■□□ 2
THUMPD2Q9BTF0 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
THUMPD2Q9BTF0 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
THUMPD2Q9BTF0 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
THUMPD2Q9BTF0 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
THUMPD2Q9BTF0 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
THUMPD2Q9BTF0 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
THUMPD2Q9BTF0 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
THUMPD2Q9BTF0 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
THUMPD2Q9BTF0 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
THUMPD2Q9BTF0 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
THUMPD2Q9BTF0 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
THUMPD2Q9BTF0 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
THUMPD2Q9BTF0 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.51■■■□□ 2
THUMPD2Q9BTF0 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
THUMPD2Q9BTF0 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
THUMPD2Q9BTF0 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
THUMPD2Q9BTF0 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
THUMPD2Q9BTF0 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
THUMPD2Q9BTF0 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
THUMPD2Q9BTF0 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
THUMPD2Q9BTF0 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
THUMPD2Q9BTF0 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
THUMPD2Q9BTF0 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
THUMPD2Q9BTF0 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
THUMPD2Q9BTF0 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
THUMPD2Q9BTF0 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
THUMPD2Q9BTF0 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms