Protein–RNA interactions for Protein: Q99638

RAD9A, Cell cycle checkpoint control protein RAD9A, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD9AQ99638 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAD9AQ99638 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAD9AQ99638 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAD9AQ99638 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAD9AQ99638 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
RAD9AQ99638 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RAD9AQ99638 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RAD9AQ99638 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RAD9AQ99638 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RAD9AQ99638 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RAD9AQ99638 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RAD9AQ99638 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RAD9AQ99638 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RAD9AQ99638 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RAD9AQ99638 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RAD9AQ99638 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RAD9AQ99638 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RAD9AQ99638 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RAD9AQ99638 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RAD9AQ99638 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
RAD9AQ99638 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RAD9AQ99638 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RAD9AQ99638 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RAD9AQ99638 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RAD9AQ99638 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RAD9AQ99638 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
RAD9AQ99638 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
RAD9AQ99638 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RAD9AQ99638 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RAD9AQ99638 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RAD9AQ99638 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
RAD9AQ99638 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RAD9AQ99638 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RAD9AQ99638 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RAD9AQ99638 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RAD9AQ99638 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RAD9AQ99638 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RAD9AQ99638 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
RAD9AQ99638 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RAD9AQ99638 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RAD9AQ99638 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RAD9AQ99638 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RAD9AQ99638 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RAD9AQ99638 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RAD9AQ99638 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RAD9AQ99638 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
RAD9AQ99638 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RAD9AQ99638 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
RAD9AQ99638 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RAD9AQ99638 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RAD9AQ99638 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RAD9AQ99638 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RAD9AQ99638 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RAD9AQ99638 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RAD9AQ99638 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RAD9AQ99638 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RAD9AQ99638 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RAD9AQ99638 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RAD9AQ99638 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RAD9AQ99638 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RAD9AQ99638 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
RAD9AQ99638 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RAD9AQ99638 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RAD9AQ99638 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RAD9AQ99638 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RAD9AQ99638 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RAD9AQ99638 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RAD9AQ99638 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RAD9AQ99638 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RAD9AQ99638 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RAD9AQ99638 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RAD9AQ99638 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RAD9AQ99638 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RAD9AQ99638 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RAD9AQ99638 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RAD9AQ99638 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
RAD9AQ99638 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RAD9AQ99638 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RAD9AQ99638 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RAD9AQ99638 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
RAD9AQ99638 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RAD9AQ99638 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RAD9AQ99638 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
RAD9AQ99638 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
RAD9AQ99638 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RAD9AQ99638 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RAD9AQ99638 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RAD9AQ99638 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RAD9AQ99638 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RAD9AQ99638 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RAD9AQ99638 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
RAD9AQ99638 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RAD9AQ99638 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RAD9AQ99638 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RAD9AQ99638 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RAD9AQ99638 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RAD9AQ99638 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
RAD9AQ99638 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RAD9AQ99638 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RAD9AQ99638 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms