Protein–RNA interactions for Protein: Q99460

PSMD1, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD1Q99460 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PSMD1Q99460 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PSMD1Q99460 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PSMD1Q99460 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PSMD1Q99460 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PSMD1Q99460 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PSMD1Q99460 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PSMD1Q99460 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PSMD1Q99460 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PSMD1Q99460 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PSMD1Q99460 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PSMD1Q99460 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC25.83■■□□□ 1.72
PSMD1Q99460 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
PSMD1Q99460 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PSMD1Q99460 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PSMD1Q99460 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PSMD1Q99460 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PSMD1Q99460 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
PSMD1Q99460 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PSMD1Q99460 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PSMD1Q99460 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PSMD1Q99460 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PSMD1Q99460 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PSMD1Q99460 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PSMD1Q99460 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PSMD1Q99460 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PSMD1Q99460 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
PSMD1Q99460 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
PSMD1Q99460 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PSMD1Q99460 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PSMD1Q99460 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PSMD1Q99460 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PSMD1Q99460 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PSMD1Q99460 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PSMD1Q99460 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PSMD1Q99460 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PSMD1Q99460 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PSMD1Q99460 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
PSMD1Q99460 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PSMD1Q99460 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PSMD1Q99460 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PSMD1Q99460 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PSMD1Q99460 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PSMD1Q99460 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PSMD1Q99460 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PSMD1Q99460 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PSMD1Q99460 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PSMD1Q99460 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
PSMD1Q99460 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PSMD1Q99460 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PSMD1Q99460 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
PSMD1Q99460 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PSMD1Q99460 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PSMD1Q99460 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PSMD1Q99460 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
PSMD1Q99460 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PSMD1Q99460 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PSMD1Q99460 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PSMD1Q99460 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PSMD1Q99460 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PSMD1Q99460 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PSMD1Q99460 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PSMD1Q99460 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PSMD1Q99460 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PSMD1Q99460 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PSMD1Q99460 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PSMD1Q99460 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
PSMD1Q99460 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PSMD1Q99460 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PSMD1Q99460 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PSMD1Q99460 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PSMD1Q99460 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PSMD1Q99460 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PSMD1Q99460 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PSMD1Q99460 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PSMD1Q99460 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PSMD1Q99460 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PSMD1Q99460 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
PSMD1Q99460 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PSMD1Q99460 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PSMD1Q99460 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PSMD1Q99460 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PSMD1Q99460 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PSMD1Q99460 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PSMD1Q99460 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PSMD1Q99460 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PSMD1Q99460 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PSMD1Q99460 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PSMD1Q99460 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PSMD1Q99460 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PSMD1Q99460 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PSMD1Q99460 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PSMD1Q99460 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PSMD1Q99460 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PSMD1Q99460 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PSMD1Q99460 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PSMD1Q99460 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PSMD1Q99460 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
PSMD1Q99460 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PSMD1Q99460 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms