Protein–RNA interactions for Protein: Q96SJ8

TSPAN18, Tetraspanin-18, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN18Q96SJ8 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TSPAN18Q96SJ8 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TSPAN18Q96SJ8 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TSPAN18Q96SJ8 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TSPAN18Q96SJ8 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TSPAN18Q96SJ8 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TSPAN18Q96SJ8 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TSPAN18Q96SJ8 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
TSPAN18Q96SJ8 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TSPAN18Q96SJ8 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TSPAN18Q96SJ8 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TSPAN18Q96SJ8 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TSPAN18Q96SJ8 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
TSPAN18Q96SJ8 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TSPAN18Q96SJ8 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TSPAN18Q96SJ8 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TSPAN18Q96SJ8 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TSPAN18Q96SJ8 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TSPAN18Q96SJ8 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TSPAN18Q96SJ8 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TSPAN18Q96SJ8 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TSPAN18Q96SJ8 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TSPAN18Q96SJ8 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TSPAN18Q96SJ8 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TSPAN18Q96SJ8 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TSPAN18Q96SJ8 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TSPAN18Q96SJ8 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TSPAN18Q96SJ8 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TSPAN18Q96SJ8 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TSPAN18Q96SJ8 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TSPAN18Q96SJ8 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TSPAN18Q96SJ8 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TSPAN18Q96SJ8 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
TSPAN18Q96SJ8 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TSPAN18Q96SJ8 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TSPAN18Q96SJ8 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TSPAN18Q96SJ8 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TSPAN18Q96SJ8 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TSPAN18Q96SJ8 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TSPAN18Q96SJ8 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TSPAN18Q96SJ8 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TSPAN18Q96SJ8 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TSPAN18Q96SJ8 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TSPAN18Q96SJ8 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TSPAN18Q96SJ8 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
TSPAN18Q96SJ8 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TSPAN18Q96SJ8 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TSPAN18Q96SJ8 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TSPAN18Q96SJ8 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TSPAN18Q96SJ8 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TSPAN18Q96SJ8 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TSPAN18Q96SJ8 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TSPAN18Q96SJ8 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TSPAN18Q96SJ8 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TSPAN18Q96SJ8 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TSPAN18Q96SJ8 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TSPAN18Q96SJ8 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TSPAN18Q96SJ8 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
TSPAN18Q96SJ8 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TSPAN18Q96SJ8 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TSPAN18Q96SJ8 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TSPAN18Q96SJ8 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TSPAN18Q96SJ8 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TSPAN18Q96SJ8 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TSPAN18Q96SJ8 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TSPAN18Q96SJ8 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TSPAN18Q96SJ8 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TSPAN18Q96SJ8 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TSPAN18Q96SJ8 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TSPAN18Q96SJ8 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TSPAN18Q96SJ8 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TSPAN18Q96SJ8 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
TSPAN18Q96SJ8 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
TSPAN18Q96SJ8 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
TSPAN18Q96SJ8 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TSPAN18Q96SJ8 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TSPAN18Q96SJ8 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TSPAN18Q96SJ8 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TSPAN18Q96SJ8 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TSPAN18Q96SJ8 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TSPAN18Q96SJ8 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TSPAN18Q96SJ8 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TSPAN18Q96SJ8 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TSPAN18Q96SJ8 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
TSPAN18Q96SJ8 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TSPAN18Q96SJ8 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TSPAN18Q96SJ8 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
TSPAN18Q96SJ8 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
TSPAN18Q96SJ8 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TSPAN18Q96SJ8 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TSPAN18Q96SJ8 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TSPAN18Q96SJ8 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TSPAN18Q96SJ8 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TSPAN18Q96SJ8 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TSPAN18Q96SJ8 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TSPAN18Q96SJ8 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TSPAN18Q96SJ8 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TSPAN18Q96SJ8 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TSPAN18Q96SJ8 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TSPAN18Q96SJ8 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms