Protein–RNA interactions for Protein: Q96S65

CSRNP1, Cysteine/serine-rich nuclear protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSRNP1Q96S65 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CSRNP1Q96S65 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CSRNP1Q96S65 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CSRNP1Q96S65 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CSRNP1Q96S65 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CSRNP1Q96S65 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CSRNP1Q96S65 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CSRNP1Q96S65 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CSRNP1Q96S65 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CSRNP1Q96S65 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CSRNP1Q96S65 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CSRNP1Q96S65 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CSRNP1Q96S65 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CSRNP1Q96S65 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CSRNP1Q96S65 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CSRNP1Q96S65 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CSRNP1Q96S65 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CSRNP1Q96S65 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CSRNP1Q96S65 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CSRNP1Q96S65 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CSRNP1Q96S65 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CSRNP1Q96S65 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CSRNP1Q96S65 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CSRNP1Q96S65 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CSRNP1Q96S65 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CSRNP1Q96S65 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CSRNP1Q96S65 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CSRNP1Q96S65 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CSRNP1Q96S65 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CSRNP1Q96S65 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
CSRNP1Q96S65 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CSRNP1Q96S65 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CSRNP1Q96S65 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
CSRNP1Q96S65 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CSRNP1Q96S65 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CSRNP1Q96S65 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CSRNP1Q96S65 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CSRNP1Q96S65 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CSRNP1Q96S65 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CSRNP1Q96S65 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CSRNP1Q96S65 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CSRNP1Q96S65 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CSRNP1Q96S65 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CSRNP1Q96S65 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CSRNP1Q96S65 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
CSRNP1Q96S65 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CSRNP1Q96S65 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
CSRNP1Q96S65 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CSRNP1Q96S65 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
CSRNP1Q96S65 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
CSRNP1Q96S65 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CSRNP1Q96S65 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CSRNP1Q96S65 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CSRNP1Q96S65 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CSRNP1Q96S65 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CSRNP1Q96S65 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CSRNP1Q96S65 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CSRNP1Q96S65 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CSRNP1Q96S65 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
CSRNP1Q96S65 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CSRNP1Q96S65 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CSRNP1Q96S65 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CSRNP1Q96S65 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CSRNP1Q96S65 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CSRNP1Q96S65 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CSRNP1Q96S65 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CSRNP1Q96S65 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CSRNP1Q96S65 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CSRNP1Q96S65 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CSRNP1Q96S65 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CSRNP1Q96S65 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CSRNP1Q96S65 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
CSRNP1Q96S65 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CSRNP1Q96S65 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CSRNP1Q96S65 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CSRNP1Q96S65 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CSRNP1Q96S65 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CSRNP1Q96S65 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CSRNP1Q96S65 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CSRNP1Q96S65 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CSRNP1Q96S65 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CSRNP1Q96S65 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
CSRNP1Q96S65 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CSRNP1Q96S65 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CSRNP1Q96S65 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CSRNP1Q96S65 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CSRNP1Q96S65 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CSRNP1Q96S65 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CSRNP1Q96S65 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CSRNP1Q96S65 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CSRNP1Q96S65 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CSRNP1Q96S65 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CSRNP1Q96S65 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CSRNP1Q96S65 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CSRNP1Q96S65 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CSRNP1Q96S65 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CSRNP1Q96S65 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CSRNP1Q96S65 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CSRNP1Q96S65 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
CSRNP1Q96S65 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms