Protein–RNA interactions for Protein: Q96RS6

NUDCD1, NudC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUDCD1Q96RS6 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
NUDCD1Q96RS6 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NUDCD1Q96RS6 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NUDCD1Q96RS6 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NUDCD1Q96RS6 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NUDCD1Q96RS6 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NUDCD1Q96RS6 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NUDCD1Q96RS6 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NUDCD1Q96RS6 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NUDCD1Q96RS6 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NUDCD1Q96RS6 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NUDCD1Q96RS6 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NUDCD1Q96RS6 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NUDCD1Q96RS6 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NUDCD1Q96RS6 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NUDCD1Q96RS6 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NUDCD1Q96RS6 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NUDCD1Q96RS6 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NUDCD1Q96RS6 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NUDCD1Q96RS6 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NUDCD1Q96RS6 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NUDCD1Q96RS6 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NUDCD1Q96RS6 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NUDCD1Q96RS6 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NUDCD1Q96RS6 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NUDCD1Q96RS6 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
NUDCD1Q96RS6 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NUDCD1Q96RS6 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NUDCD1Q96RS6 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NUDCD1Q96RS6 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NUDCD1Q96RS6 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NUDCD1Q96RS6 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NUDCD1Q96RS6 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NUDCD1Q96RS6 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NUDCD1Q96RS6 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
NUDCD1Q96RS6 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NUDCD1Q96RS6 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NUDCD1Q96RS6 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
NUDCD1Q96RS6 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NUDCD1Q96RS6 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NUDCD1Q96RS6 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NUDCD1Q96RS6 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NUDCD1Q96RS6 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NUDCD1Q96RS6 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NUDCD1Q96RS6 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NUDCD1Q96RS6 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NUDCD1Q96RS6 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NUDCD1Q96RS6 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NUDCD1Q96RS6 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NUDCD1Q96RS6 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NUDCD1Q96RS6 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NUDCD1Q96RS6 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
NUDCD1Q96RS6 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NUDCD1Q96RS6 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NUDCD1Q96RS6 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
NUDCD1Q96RS6 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NUDCD1Q96RS6 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NUDCD1Q96RS6 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NUDCD1Q96RS6 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NUDCD1Q96RS6 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
NUDCD1Q96RS6 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NUDCD1Q96RS6 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NUDCD1Q96RS6 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NUDCD1Q96RS6 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
NUDCD1Q96RS6 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NUDCD1Q96RS6 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NUDCD1Q96RS6 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NUDCD1Q96RS6 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NUDCD1Q96RS6 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NUDCD1Q96RS6 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NUDCD1Q96RS6 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NUDCD1Q96RS6 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NUDCD1Q96RS6 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
NUDCD1Q96RS6 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NUDCD1Q96RS6 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NUDCD1Q96RS6 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NUDCD1Q96RS6 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NUDCD1Q96RS6 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NUDCD1Q96RS6 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NUDCD1Q96RS6 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NUDCD1Q96RS6 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NUDCD1Q96RS6 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NUDCD1Q96RS6 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NUDCD1Q96RS6 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NUDCD1Q96RS6 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NUDCD1Q96RS6 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NUDCD1Q96RS6 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NUDCD1Q96RS6 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NUDCD1Q96RS6 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NUDCD1Q96RS6 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
NUDCD1Q96RS6 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
NUDCD1Q96RS6 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NUDCD1Q96RS6 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NUDCD1Q96RS6 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NUDCD1Q96RS6 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NUDCD1Q96RS6 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NUDCD1Q96RS6 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NUDCD1Q96RS6 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NUDCD1Q96RS6 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NUDCD1Q96RS6 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms