Protein–RNA interactions for Protein: Q96NK8

NEUROD6, Neurogenic differentiation factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 337 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEUROD6Q96NK8 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
NEUROD6Q96NK8 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NEUROD6Q96NK8 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NEUROD6Q96NK8 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NEUROD6Q96NK8 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
NEUROD6Q96NK8 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
NEUROD6Q96NK8 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
NEUROD6Q96NK8 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
NEUROD6Q96NK8 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
NEUROD6Q96NK8 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
NEUROD6Q96NK8 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
NEUROD6Q96NK8 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
NEUROD6Q96NK8 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
NEUROD6Q96NK8 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
NEUROD6Q96NK8 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
NEUROD6Q96NK8 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
NEUROD6Q96NK8 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
NEUROD6Q96NK8 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
NEUROD6Q96NK8 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NEUROD6Q96NK8 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
NEUROD6Q96NK8 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
NEUROD6Q96NK8 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NEUROD6Q96NK8 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NEUROD6Q96NK8 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
NEUROD6Q96NK8 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NEUROD6Q96NK8 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NEUROD6Q96NK8 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
NEUROD6Q96NK8 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NEUROD6Q96NK8 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NEUROD6Q96NK8 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
NEUROD6Q96NK8 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
NEUROD6Q96NK8 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
NEUROD6Q96NK8 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
NEUROD6Q96NK8 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NEUROD6Q96NK8 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NEUROD6Q96NK8 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NEUROD6Q96NK8 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
NEUROD6Q96NK8 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NEUROD6Q96NK8 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
NEUROD6Q96NK8 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NEUROD6Q96NK8 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
NEUROD6Q96NK8 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
NEUROD6Q96NK8 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NEUROD6Q96NK8 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NEUROD6Q96NK8 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
NEUROD6Q96NK8 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NEUROD6Q96NK8 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NEUROD6Q96NK8 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
NEUROD6Q96NK8 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NEUROD6Q96NK8 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
NEUROD6Q96NK8 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
NEUROD6Q96NK8 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
NEUROD6Q96NK8 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
NEUROD6Q96NK8 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
NEUROD6Q96NK8 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
NEUROD6Q96NK8 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NEUROD6Q96NK8 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NEUROD6Q96NK8 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NEUROD6Q96NK8 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NEUROD6Q96NK8 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NEUROD6Q96NK8 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NEUROD6Q96NK8 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC25.85■■□□□ 1.73
NEUROD6Q96NK8 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NEUROD6Q96NK8 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NEUROD6Q96NK8 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NEUROD6Q96NK8 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NEUROD6Q96NK8 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NEUROD6Q96NK8 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
NEUROD6Q96NK8 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
NEUROD6Q96NK8 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NEUROD6Q96NK8 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NEUROD6Q96NK8 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NEUROD6Q96NK8 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NEUROD6Q96NK8 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NEUROD6Q96NK8 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NEUROD6Q96NK8 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NEUROD6Q96NK8 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NEUROD6Q96NK8 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NEUROD6Q96NK8 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NEUROD6Q96NK8 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
NEUROD6Q96NK8 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
NEUROD6Q96NK8 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
NEUROD6Q96NK8 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
NEUROD6Q96NK8 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
NEUROD6Q96NK8 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
NEUROD6Q96NK8 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
NEUROD6Q96NK8 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
NEUROD6Q96NK8 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
NEUROD6Q96NK8 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NEUROD6Q96NK8 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
NEUROD6Q96NK8 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NEUROD6Q96NK8 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
NEUROD6Q96NK8 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
NEUROD6Q96NK8 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
NEUROD6Q96NK8 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
NEUROD6Q96NK8 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
NEUROD6Q96NK8 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
NEUROD6Q96NK8 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
NEUROD6Q96NK8 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
NEUROD6Q96NK8 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms