Protein–RNA interactions for Protein: Q96KR7

PHACTR3, Phosphatase and actin regulator 3, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHACTR3Q96KR7 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PHACTR3Q96KR7 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
PHACTR3Q96KR7 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PHACTR3Q96KR7 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PHACTR3Q96KR7 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
PHACTR3Q96KR7 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
PHACTR3Q96KR7 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PHACTR3Q96KR7 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PHACTR3Q96KR7 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PHACTR3Q96KR7 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PHACTR3Q96KR7 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PHACTR3Q96KR7 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PHACTR3Q96KR7 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PHACTR3Q96KR7 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PHACTR3Q96KR7 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PHACTR3Q96KR7 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
PHACTR3Q96KR7 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PHACTR3Q96KR7 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PHACTR3Q96KR7 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PHACTR3Q96KR7 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
PHACTR3Q96KR7 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PHACTR3Q96KR7 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PHACTR3Q96KR7 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PHACTR3Q96KR7 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PHACTR3Q96KR7 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PHACTR3Q96KR7 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
PHACTR3Q96KR7 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
PHACTR3Q96KR7 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
PHACTR3Q96KR7 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PHACTR3Q96KR7 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
PHACTR3Q96KR7 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
PHACTR3Q96KR7 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
PHACTR3Q96KR7 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
PHACTR3Q96KR7 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PHACTR3Q96KR7 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PHACTR3Q96KR7 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PHACTR3Q96KR7 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PHACTR3Q96KR7 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
PHACTR3Q96KR7 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
PHACTR3Q96KR7 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PHACTR3Q96KR7 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PHACTR3Q96KR7 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PHACTR3Q96KR7 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PHACTR3Q96KR7 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PHACTR3Q96KR7 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PHACTR3Q96KR7 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PHACTR3Q96KR7 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PHACTR3Q96KR7 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PHACTR3Q96KR7 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PHACTR3Q96KR7 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PHACTR3Q96KR7 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PHACTR3Q96KR7 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PHACTR3Q96KR7 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PHACTR3Q96KR7 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PHACTR3Q96KR7 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PHACTR3Q96KR7 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
PHACTR3Q96KR7 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PHACTR3Q96KR7 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
PHACTR3Q96KR7 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PHACTR3Q96KR7 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PHACTR3Q96KR7 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PHACTR3Q96KR7 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PHACTR3Q96KR7 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PHACTR3Q96KR7 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
PHACTR3Q96KR7 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC27.76■■■□□ 2.04
PHACTR3Q96KR7 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
PHACTR3Q96KR7 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PHACTR3Q96KR7 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC27.76■■■□□ 2.03
PHACTR3Q96KR7 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
PHACTR3Q96KR7 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PHACTR3Q96KR7 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
PHACTR3Q96KR7 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PHACTR3Q96KR7 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
PHACTR3Q96KR7 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PHACTR3Q96KR7 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PHACTR3Q96KR7 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PHACTR3Q96KR7 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PHACTR3Q96KR7 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
PHACTR3Q96KR7 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
PHACTR3Q96KR7 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
PHACTR3Q96KR7 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PHACTR3Q96KR7 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PHACTR3Q96KR7 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PHACTR3Q96KR7 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PHACTR3Q96KR7 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PHACTR3Q96KR7 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PHACTR3Q96KR7 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PHACTR3Q96KR7 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PHACTR3Q96KR7 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PHACTR3Q96KR7 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PHACTR3Q96KR7 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PHACTR3Q96KR7 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PHACTR3Q96KR7 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PHACTR3Q96KR7 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PHACTR3Q96KR7 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PHACTR3Q96KR7 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PHACTR3Q96KR7 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PHACTR3Q96KR7 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PHACTR3Q96KR7 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
PHACTR3Q96KR7 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms