Protein–RNA interactions for Protein: Q96HF1

SFRP2, Secreted frizzled-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFRP2Q96HF1 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SFRP2Q96HF1 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SFRP2Q96HF1 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SFRP2Q96HF1 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SFRP2Q96HF1 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SFRP2Q96HF1 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SFRP2Q96HF1 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SFRP2Q96HF1 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SFRP2Q96HF1 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SFRP2Q96HF1 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SFRP2Q96HF1 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SFRP2Q96HF1 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SFRP2Q96HF1 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SFRP2Q96HF1 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SFRP2Q96HF1 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SFRP2Q96HF1 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SFRP2Q96HF1 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SFRP2Q96HF1 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SFRP2Q96HF1 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SFRP2Q96HF1 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SFRP2Q96HF1 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SFRP2Q96HF1 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SFRP2Q96HF1 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SFRP2Q96HF1 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SFRP2Q96HF1 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SFRP2Q96HF1 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SFRP2Q96HF1 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SFRP2Q96HF1 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SFRP2Q96HF1 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SFRP2Q96HF1 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SFRP2Q96HF1 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SFRP2Q96HF1 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SFRP2Q96HF1 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SFRP2Q96HF1 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SFRP2Q96HF1 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SFRP2Q96HF1 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SFRP2Q96HF1 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SFRP2Q96HF1 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SFRP2Q96HF1 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SFRP2Q96HF1 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SFRP2Q96HF1 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SFRP2Q96HF1 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SFRP2Q96HF1 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SFRP2Q96HF1 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SFRP2Q96HF1 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SFRP2Q96HF1 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SFRP2Q96HF1 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SFRP2Q96HF1 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SFRP2Q96HF1 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SFRP2Q96HF1 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SFRP2Q96HF1 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SFRP2Q96HF1 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SFRP2Q96HF1 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SFRP2Q96HF1 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SFRP2Q96HF1 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SFRP2Q96HF1 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SFRP2Q96HF1 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SFRP2Q96HF1 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SFRP2Q96HF1 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SFRP2Q96HF1 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SFRP2Q96HF1 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SFRP2Q96HF1 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SFRP2Q96HF1 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SFRP2Q96HF1 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SFRP2Q96HF1 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SFRP2Q96HF1 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SFRP2Q96HF1 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SFRP2Q96HF1 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SFRP2Q96HF1 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SFRP2Q96HF1 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SFRP2Q96HF1 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SFRP2Q96HF1 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SFRP2Q96HF1 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SFRP2Q96HF1 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SFRP2Q96HF1 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SFRP2Q96HF1 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SFRP2Q96HF1 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SFRP2Q96HF1 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SFRP2Q96HF1 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SFRP2Q96HF1 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SFRP2Q96HF1 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SFRP2Q96HF1 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SFRP2Q96HF1 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SFRP2Q96HF1 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SFRP2Q96HF1 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SFRP2Q96HF1 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SFRP2Q96HF1 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SFRP2Q96HF1 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SFRP2Q96HF1 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SFRP2Q96HF1 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SFRP2Q96HF1 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SFRP2Q96HF1 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SFRP2Q96HF1 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
SFRP2Q96HF1 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
SFRP2Q96HF1 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SFRP2Q96HF1 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SFRP2Q96HF1 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SFRP2Q96HF1 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SFRP2Q96HF1 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SFRP2Q96HF1 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms