Protein–RNA interactions for Protein: Q96FM1

PGAP3, Post-GPI attachment to proteins factor 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGAP3Q96FM1 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PGAP3Q96FM1 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PGAP3Q96FM1 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PGAP3Q96FM1 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PGAP3Q96FM1 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PGAP3Q96FM1 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PGAP3Q96FM1 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PGAP3Q96FM1 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PGAP3Q96FM1 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PGAP3Q96FM1 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PGAP3Q96FM1 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PGAP3Q96FM1 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PGAP3Q96FM1 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
PGAP3Q96FM1 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PGAP3Q96FM1 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PGAP3Q96FM1 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PGAP3Q96FM1 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PGAP3Q96FM1 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PGAP3Q96FM1 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PGAP3Q96FM1 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PGAP3Q96FM1 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PGAP3Q96FM1 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PGAP3Q96FM1 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PGAP3Q96FM1 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PGAP3Q96FM1 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PGAP3Q96FM1 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PGAP3Q96FM1 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PGAP3Q96FM1 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PGAP3Q96FM1 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PGAP3Q96FM1 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PGAP3Q96FM1 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PGAP3Q96FM1 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PGAP3Q96FM1 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PGAP3Q96FM1 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PGAP3Q96FM1 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
PGAP3Q96FM1 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PGAP3Q96FM1 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PGAP3Q96FM1 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PGAP3Q96FM1 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PGAP3Q96FM1 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PGAP3Q96FM1 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PGAP3Q96FM1 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PGAP3Q96FM1 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PGAP3Q96FM1 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PGAP3Q96FM1 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PGAP3Q96FM1 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PGAP3Q96FM1 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PGAP3Q96FM1 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PGAP3Q96FM1 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
PGAP3Q96FM1 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PGAP3Q96FM1 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PGAP3Q96FM1 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PGAP3Q96FM1 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PGAP3Q96FM1 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PGAP3Q96FM1 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PGAP3Q96FM1 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PGAP3Q96FM1 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PGAP3Q96FM1 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PGAP3Q96FM1 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PGAP3Q96FM1 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PGAP3Q96FM1 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PGAP3Q96FM1 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
PGAP3Q96FM1 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PGAP3Q96FM1 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PGAP3Q96FM1 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PGAP3Q96FM1 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PGAP3Q96FM1 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PGAP3Q96FM1 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PGAP3Q96FM1 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PGAP3Q96FM1 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PGAP3Q96FM1 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PGAP3Q96FM1 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PGAP3Q96FM1 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PGAP3Q96FM1 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PGAP3Q96FM1 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PGAP3Q96FM1 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PGAP3Q96FM1 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PGAP3Q96FM1 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PGAP3Q96FM1 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PGAP3Q96FM1 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PGAP3Q96FM1 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PGAP3Q96FM1 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PGAP3Q96FM1 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
PGAP3Q96FM1 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
PGAP3Q96FM1 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PGAP3Q96FM1 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PGAP3Q96FM1 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PGAP3Q96FM1 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PGAP3Q96FM1 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PGAP3Q96FM1 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PGAP3Q96FM1 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PGAP3Q96FM1 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PGAP3Q96FM1 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
PGAP3Q96FM1 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PGAP3Q96FM1 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PGAP3Q96FM1 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PGAP3Q96FM1 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
PGAP3Q96FM1 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PGAP3Q96FM1 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PGAP3Q96FM1 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms