Protein–RNA interactions for Protein: Q96CG3

TIFA, TRAF-interacting protein with FHA domain-containing protein A, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIFAQ96CG3 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TIFAQ96CG3 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
TIFAQ96CG3 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TIFAQ96CG3 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TIFAQ96CG3 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TIFAQ96CG3 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TIFAQ96CG3 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
TIFAQ96CG3 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
TIFAQ96CG3 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
TIFAQ96CG3 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TIFAQ96CG3 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TIFAQ96CG3 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TIFAQ96CG3 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
TIFAQ96CG3 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TIFAQ96CG3 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TIFAQ96CG3 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TIFAQ96CG3 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TIFAQ96CG3 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TIFAQ96CG3 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TIFAQ96CG3 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
TIFAQ96CG3 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TIFAQ96CG3 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
TIFAQ96CG3 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TIFAQ96CG3 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TIFAQ96CG3 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
TIFAQ96CG3 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
TIFAQ96CG3 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TIFAQ96CG3 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
TIFAQ96CG3 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TIFAQ96CG3 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TIFAQ96CG3 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TIFAQ96CG3 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TIFAQ96CG3 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TIFAQ96CG3 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TIFAQ96CG3 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TIFAQ96CG3 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TIFAQ96CG3 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TIFAQ96CG3 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TIFAQ96CG3 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TIFAQ96CG3 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TIFAQ96CG3 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TIFAQ96CG3 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TIFAQ96CG3 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TIFAQ96CG3 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TIFAQ96CG3 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TIFAQ96CG3 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TIFAQ96CG3 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TIFAQ96CG3 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TIFAQ96CG3 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TIFAQ96CG3 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TIFAQ96CG3 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TIFAQ96CG3 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
TIFAQ96CG3 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TIFAQ96CG3 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TIFAQ96CG3 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TIFAQ96CG3 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TIFAQ96CG3 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TIFAQ96CG3 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TIFAQ96CG3 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TIFAQ96CG3 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TIFAQ96CG3 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TIFAQ96CG3 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TIFAQ96CG3 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TIFAQ96CG3 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TIFAQ96CG3 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TIFAQ96CG3 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
TIFAQ96CG3 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TIFAQ96CG3 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TIFAQ96CG3 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TIFAQ96CG3 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TIFAQ96CG3 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TIFAQ96CG3 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
TIFAQ96CG3 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TIFAQ96CG3 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TIFAQ96CG3 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TIFAQ96CG3 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TIFAQ96CG3 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TIFAQ96CG3 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TIFAQ96CG3 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TIFAQ96CG3 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TIFAQ96CG3 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
TIFAQ96CG3 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
TIFAQ96CG3 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TIFAQ96CG3 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
TIFAQ96CG3 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TIFAQ96CG3 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TIFAQ96CG3 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TIFAQ96CG3 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TIFAQ96CG3 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TIFAQ96CG3 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TIFAQ96CG3 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
TIFAQ96CG3 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TIFAQ96CG3 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TIFAQ96CG3 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TIFAQ96CG3 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TIFAQ96CG3 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TIFAQ96CG3 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TIFAQ96CG3 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TIFAQ96CG3 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TIFAQ96CG3 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms