Protein–RNA interactions for Protein: Q96C34

RUNDC1, RUN domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNDC1Q96C34 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
RUNDC1Q96C34 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
RUNDC1Q96C34 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
RUNDC1Q96C34 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
RUNDC1Q96C34 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
RUNDC1Q96C34 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
RUNDC1Q96C34 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
RUNDC1Q96C34 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC27.88■■■□□ 2.05
RUNDC1Q96C34 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
RUNDC1Q96C34 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
RUNDC1Q96C34 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC27.87■■■□□ 2.05
RUNDC1Q96C34 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC27.87■■■□□ 2.05
RUNDC1Q96C34 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
RUNDC1Q96C34 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
RUNDC1Q96C34 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
RUNDC1Q96C34 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
RUNDC1Q96C34 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
RUNDC1Q96C34 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
RUNDC1Q96C34 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
RUNDC1Q96C34 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
RUNDC1Q96C34 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
RUNDC1Q96C34 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC27.86■■■□□ 2.05
RUNDC1Q96C34 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
RUNDC1Q96C34 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
RUNDC1Q96C34 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
RUNDC1Q96C34 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
RUNDC1Q96C34 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
RUNDC1Q96C34 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
RUNDC1Q96C34 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
RUNDC1Q96C34 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
RUNDC1Q96C34 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
RUNDC1Q96C34 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
RUNDC1Q96C34 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
RUNDC1Q96C34 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
RUNDC1Q96C34 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
RUNDC1Q96C34 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
RUNDC1Q96C34 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
RUNDC1Q96C34 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
RUNDC1Q96C34 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
RUNDC1Q96C34 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
RUNDC1Q96C34 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
RUNDC1Q96C34 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC27.84■■■□□ 2.05
RUNDC1Q96C34 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
RUNDC1Q96C34 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
RUNDC1Q96C34 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
RUNDC1Q96C34 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
RUNDC1Q96C34 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
RUNDC1Q96C34 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC27.84■■■□□ 2.05
RUNDC1Q96C34 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
RUNDC1Q96C34 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
RUNDC1Q96C34 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
RUNDC1Q96C34 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
RUNDC1Q96C34 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
RUNDC1Q96C34 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
RUNDC1Q96C34 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
RUNDC1Q96C34 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
RUNDC1Q96C34 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
RUNDC1Q96C34 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
RUNDC1Q96C34 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
RUNDC1Q96C34 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
RUNDC1Q96C34 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
RUNDC1Q96C34 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
RUNDC1Q96C34 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
RUNDC1Q96C34 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
RUNDC1Q96C34 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
RUNDC1Q96C34 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
RUNDC1Q96C34 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
RUNDC1Q96C34 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
RUNDC1Q96C34 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
RUNDC1Q96C34 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
RUNDC1Q96C34 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
RUNDC1Q96C34 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
RUNDC1Q96C34 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
RUNDC1Q96C34 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
RUNDC1Q96C34 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
RUNDC1Q96C34 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
RUNDC1Q96C34 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
RUNDC1Q96C34 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
RUNDC1Q96C34 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
RUNDC1Q96C34 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
RUNDC1Q96C34 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
RUNDC1Q96C34 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
RUNDC1Q96C34 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
RUNDC1Q96C34 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
RUNDC1Q96C34 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
RUNDC1Q96C34 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
RUNDC1Q96C34 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
RUNDC1Q96C34 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
RUNDC1Q96C34 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
RUNDC1Q96C34 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
RUNDC1Q96C34 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
RUNDC1Q96C34 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
RUNDC1Q96C34 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
RUNDC1Q96C34 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
RUNDC1Q96C34 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
RUNDC1Q96C34 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
RUNDC1Q96C34 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
RUNDC1Q96C34 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
RUNDC1Q96C34 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
RUNDC1Q96C34 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.5 ms