Protein–RNA interactions for Protein: Q92973

TNPO1, Transportin-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 898 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNPO1Q92973 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TNPO1Q92973 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TNPO1Q92973 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TNPO1Q92973 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TNPO1Q92973 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TNPO1Q92973 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TNPO1Q92973 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TNPO1Q92973 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TNPO1Q92973 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TNPO1Q92973 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TNPO1Q92973 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TNPO1Q92973 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TNPO1Q92973 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
TNPO1Q92973 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TNPO1Q92973 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TNPO1Q92973 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TNPO1Q92973 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TNPO1Q92973 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TNPO1Q92973 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TNPO1Q92973 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TNPO1Q92973 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TNPO1Q92973 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TNPO1Q92973 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
TNPO1Q92973 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TNPO1Q92973 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
TNPO1Q92973 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
TNPO1Q92973 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
TNPO1Q92973 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC25■■□□□ 1.59
TNPO1Q92973 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
TNPO1Q92973 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
TNPO1Q92973 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TNPO1Q92973 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TNPO1Q92973 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TNPO1Q92973 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TNPO1Q92973 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TNPO1Q92973 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TNPO1Q92973 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TNPO1Q92973 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TNPO1Q92973 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TNPO1Q92973 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
TNPO1Q92973 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
TNPO1Q92973 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TNPO1Q92973 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TNPO1Q92973 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TNPO1Q92973 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TNPO1Q92973 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TNPO1Q92973 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TNPO1Q92973 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TNPO1Q92973 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TNPO1Q92973 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TNPO1Q92973 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TNPO1Q92973 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TNPO1Q92973 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TNPO1Q92973 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TNPO1Q92973 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TNPO1Q92973 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TNPO1Q92973 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TNPO1Q92973 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TNPO1Q92973 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TNPO1Q92973 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TNPO1Q92973 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TNPO1Q92973 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TNPO1Q92973 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TNPO1Q92973 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TNPO1Q92973 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TNPO1Q92973 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TNPO1Q92973 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TNPO1Q92973 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TNPO1Q92973 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TNPO1Q92973 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TNPO1Q92973 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TNPO1Q92973 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TNPO1Q92973 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TNPO1Q92973 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TNPO1Q92973 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TNPO1Q92973 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TNPO1Q92973 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TNPO1Q92973 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TNPO1Q92973 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TNPO1Q92973 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TNPO1Q92973 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TNPO1Q92973 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TNPO1Q92973 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
TNPO1Q92973 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TNPO1Q92973 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
TNPO1Q92973 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
TNPO1Q92973 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TNPO1Q92973 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TNPO1Q92973 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
TNPO1Q92973 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TNPO1Q92973 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
TNPO1Q92973 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
TNPO1Q92973 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TNPO1Q92973 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TNPO1Q92973 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TNPO1Q92973 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TNPO1Q92973 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
TNPO1Q92973 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TNPO1Q92973 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TNPO1Q92973 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms